Basic Information

Symbol
LCT
RNA Class
mRNA
Alias
lactase LAC LPH LPH1 lactase/phlorizin hydrolase lactase-glycosylceramidase lactase-phlorizin hydrolase-1 Lactase/phlorizin hydrolase Lactase/glycosylceramidase EC 3.2.1
Location (GRCh38)
2:135787850-135837184 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_002299.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_002299.4
Sequence length
6273 nt
GC Content
0.5224

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2194.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2304.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1860.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_002299.4 AACAGUUCCUAGAAAAUGGAGCUGUCUUGGCAUGUAGUCUUUAUUGCCC… 6273 nt 0.5224
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the glycosyl hydrolase 1 family of proteins. The encoded preproprotein is proteolytically processed to generate the mature enzyme. This enzyme is integral to the plasma membrane and has both phlorizin hydrolase activity and lactase activity. Mutations in this gene are associated with congenital lactase deficiency. Polymorphisms in this gene are associated with lactase persistence, in which intestinal lactase activity persists at childhood levels into adulthood. [provided by RefSeq, Jan 2016]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image