Basic Information
Symbol
LEMD2
RNA Class
mRNA
Alias
LEM domain nuclear envelope protein 2
dJ482C21.1
NET25
LEM2
lamina-associated polypeptide-emerin-MAN1 domain containing 2
LEM domain containing 2
CTRCT42
MARUPS
LEM domain-containing protein 2
hLEM2
Location (GRCh38)
6:33771202-33789148
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_181336.4
Sequence length
2941 nt
GC Content
0.6205
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1362.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1406.06 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
408.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001143944.1 | CAUUUUGCUGUCUGCAUUUUAAAAGUGCCUUCCUUAGAUGACAUCUUUC… | 2376 nt | 0.5556 |
| NM_001348709.2 | GCGGCGUCCUGGCCAUGGCCGGCCUGUCGGACCUGGAACUGCGGCGGGA… | 2547 nt | 0.5987 |
| NM_001348710.2 | GCGGCGUCCUGGCCAUGGCCGGCCUGUCGGACCUGGAACUGCGGCGGGA… | 2542 nt | 0.5991 |
| NM_181336.4 | GCGGCGUCCUGGCCAUGGCCGGCCUGUCGGACCUGGAACUGCGGCGGGA… | 2941 nt | 0.6205 |
Summary
This gene encodes a LEM domain-containing transmembrane protein of the inner nuclear membrane. The protein is involved in nuclear structure organization and plays a role in cell signaling and differentiation. Mutations in this gene result in Cataract 46, juvenile-onset. Multiple transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2017]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
