Basic Information

Symbol
LORICRIN
RNA Class
mRNA
Alias
loricrin cornified envelope precursor protein loricrin LOR LRN Loricrin
Location (GRCh38)
1:153259687-153262124 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_000427.3
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_000427.3
Sequence length
1245 nt
GC Content
0.6900

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-625.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -643.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 551.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((.((((((.......................)))))).((((((((..(((......(((((...))))).....)))..)).))))))(((((..((((((.((.(.(((.(.(.((.(((((((((((.((.((((((((.((.((..((.(((.(((((((((((((....(.((.((.((.((((...)))).)).)).)).)....)))))))))))))))).)))).)).))))))...)).)).)))))..)))))))).).))))).))))))))))))).((((((((.((.((.(((((..(((((....)))))(((((...(.(((((((.(((.(((.((.((((.((((((((.((((((((((((.(((.(((((((((....)))))..)))).))).)))(((.(((((((((((((((.(((((.((((((.....)))))).))))).)).)).))))))).)))))))((((((...((.(((.((((((((((..((.(((((....))))))).)))........((((((((....((((((.(((((.((((((((.(((((.((((((.....)))))).))))).))(.(((((.(((((((((....(((....))).)))))))))))))).)..)))))).)).))).)))...))))))))))).((((..(((((.....)))))..))))..((((..(((.....)))..)))))))).))).))).)).)))))).((....)).((((((.....))))))))))))))).)))))))).)))).)).))).))))))))))).))))).((.((((......)))).))....(((((((((.((((((.....)))))).)))))).))).(((((((((((((((((.((((...)))).))..(((((((....(((((...........)))))....))))))).(((((..(((......)))...)))))...)))))))))....((((((.(((((.(((((((((((((.((..(((((...)))))...)).)))).....(((((.(((.........)))...))))).))))))))).))).)).))))))..))))))...(((((.(((.....((((.....))))...))).)))))))))))).))))))))))...............))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,{,.,{{,,,,{{.({{{{....(,,(,,,{.,||||{{,((((((((..(({.,....(((({...}))))....,)))..)).)))))}(((({,.((((((.,,{(,((({{,...{.((((((((.((.((.((.(.((.(((.(((((.((....)).))))).))).)}.).)).)).)).)).)))))),}.||.||.}||||,,..|||||||}}}||{{|{({({,{{.||||,,.}}}),)).))))),}}})))}}}{|||||,},}))))))}))))).{{{{{{|{,||,||,{||||||(((((....)))))((({,...,,(((((((.(((.(({|(|,((({,((((((((.((((({,({(({.(({,(((((((((....)))))|.}}}|.))).|)){|(|{{({(({{{((((((,(({{{.{(((({.....}))))}.))))).}}|}}.}}}))))}|))}}},||||||,|,{({(((,{(({({((((,.{{.(((((....)))))}}.))}.,.||,.,((((({((,.,,.{,||{,{|{||.||{(((((.(((((.((((((.....)))))).))))),||(.(((({,({(((({{{..{{({{.,||}}|,}}|||||||}||||,|..},||||.||,}}}.)))}}}),.}})))))).{(((,.(((((.....)))))..)))},|||||.||||.....|}}||}}}}||||.||}.|}||||.||{|||.((....)).)))))}.,,}),})}}}})))))))).}||}||}}.})}|,}},}||.|||}|}}}})}.})))).||.||||,.....}})),)),|||||||(((((.((((((.....)))))).)))))}|||}{||,{|||||||||||{|||||,|||||}||||..{({|{||}}}.,||||}.},....,,.)}))).},.)})))),.||||))}}||......}}.,,}))}))},}}}},)||||,}}}||}|{{||||{|||{,{{{{(((((({|{,,((({{..,|||}}.,.,},}))).,,.,(((((.{{{.........}}}...}}))}.}})))}|{{{{{{{..{||||,,.{(((.{|,....,,...))))...))}}))..)))))))),....,},})))))}),)}))})))))}}.,.,,,.....,,)},.......,,},.

Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_000427.3 ACAUUGCCAGCAUCUUCUCUCCUCACUCACCCUUCCUGGUGCUUUGGGC… 1245 nt 0.6900
Summary

This gene encodes loricrin, a major protein component of the cornified cell envelope found in terminally differentiated epidermal cells. Mutations in this gene are associated with Vohwinkel's syndrome and progressive symmetric erythrokeratoderma, both inherited skin diseases. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image