Basic Information

Symbol
LOXL2
RNA Class
mRNA
Alias
lysyl oxidase like 2 WS9-14 LOR lysyl oxidase-like 2 LOR2 lysyl oxidase homolog 2 lysyl oxidase related 2 lysyl oxidase-like 2 delta e13 lysyl oxidase-like 2 protein lysyl oxidase-like protein 2 lysyl oxidase-related protein 2 lysyl oxidase-related protein WS9-14 Lysyl oxidase homolog 2 Lysyl oxidase-like protein 2 Lysyl oxidase-related protein 2 Lysyl oxidase-related protein WS9-14 EC 1.4.3.13 EC 1.4.3
Location (GRCh38)
8:23296897-23425328 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_002318.3
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_002318.3
Sequence length
3721 nt
GC Content
0.5748

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1436.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1499.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1057.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_002318.3 GCGACUCCAGCGCGCGGCUACCUACGCUUGGUGCUUGCUUUCUCCAGCC… 3721 nt 0.5748
Summary

This gene encodes a member of the lysyl oxidase gene family. The prototypic member of the family is essential to the biogenesis of connective tissue, encoding an extracellular copper-dependent amine oxidase that catalyses the first step in the formation of crosslinks in collagens and elastin. A highly conserved amino acid sequence at the C-terminus end appears to be sufficient for amine oxidase activity, suggesting that each family member may retain this function. The N-terminus is poorly conserved and may impart additional roles in developmental regulation, senescence, tumor suppression, cell growth control, and chemotaxis to each member of the family. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image