Basic Information
Symbol
LPAR1
RNA Class
mRNA
Alias
lysophosphatidic acid receptor 1
edg-2
rec.1.3
vzg-1
Gpcr26
Mrec1.3
LPA1
endothelial differentiation, lysophosphatidic acid G-protein-coupled receptor, 2
EDG2
VZG1
LPA receptor 1
LPA-1
lysophosphatidic acid receptor Edg-2
ventricular zone gene 1
Lysophosphatidic acid receptor 1
Lysophosphatidic acid receptor Edg-2
Location (GRCh38)
9:110871773-111038863
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001351411.2
Sequence length
3818 nt
GC Content
0.4434
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1147.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1224.23 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
870.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001351417.2 | ACACGGCGCGCUGGGCUCACACUGUCCCGCCGCGGACGGGCUUUGUGGU… | 3761 nt | 0.4337 |
| NM_001351418.2 | ACACGGCGCGCUGGGCUCACACUGUCCCGCCGCGGACGGGCUUUGUGGU… | 3869 nt | 0.4319 |
| NM_001351419.2 | GAGGACUUUUAACUAAGUUUCUGUCCAGCCGCCUAACAAACGUGCUUAA… | 3662 nt | 0.4123 |
| NM_001351420.2 | AGGAUAAAAACACCAAGUGGCAAGAGAAGGAGGUAGCUUGAGGCAGGAA… | 3707 nt | 0.4203 |
| NM_001387470.1 | ACAUUUCCGGGGUUUUGCGGGCCCCGCGAUGUUUUCCAGAGCUUUUCGA… | 3651 nt | 0.4177 |
| NM_001387471.1 | ACAUUUCCGGGGUUUUGCGGGCCCCGCGAUGUUUUCCAGAGCUUUUCGA… | 3485 nt | 0.4135 |
| NM_001387472.1 | ACAUUUCCGGGGUUUUGCGGGCCCCGCGAUGUUUUCCAGAGCUUUUCGA… | 3643 nt | 0.4181 |
| NM_001387473.1 | ACAUUUCCGGGGUUUUGCGGGCCCCGCGAUGUUUUCCAGAGCUUUUCGA… | 3835 nt | 0.4154 |
| NM_001387474.1 | ACAUUUCCGGGGUUUUGCGGGCCCCGCGAUGUUUUCCAGAGCUUUUCGA… | 3781 nt | 0.4171 |
| NM_001387475.1 | ACAUUUCCGGGGUUUUGCGGGCCCCGCGAUGUUUUCCAGAGCUUUUCGA… | 3638 nt | 0.4186 |
Showing 21 to 30 of 76 entries
Summary
The integral membrane protein encoded by this gene is a lysophosphatidic acid (LPA) receptor from a group known as EDG receptors. These receptors are members of the G protein-coupled receptor superfamily. Utilized by LPA for cell signaling, EDG receptors mediate diverse biologic functions, including proliferation, platelet aggregation, smooth muscle contraction, inhibition of neuroblastoma cell differentiation, chemotaxis, and tumor cell invasion. Many transcript variants encoding a few different isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2020]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
