Basic Information

Symbol
ANKRD28
RNA Class
mRNA
Alias
ankyrin repeat domain 28 KIAA0379 PITK PP6-ARS-A PPP1R65 FAP79 CFAP79 phosphatase interactor targeting K protein protein phosphatase 6 ankyrin repeat subunit A protein phosphatase 1, regulatory subunit 65 serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A ankyrin repeat domain-containing protein 28 phosphatase interactor targeting protein hnRNP K serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit ARS-A Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit ARS-A Ankyrin repeat domain-containing protein 28 Phosphatase interactor targeting protein hnRNP K
Location (GRCh38)
3:15667236-15859771 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001195098.1
BLAST PRIMER
NM_001195099.2
BLAST PRIMER
NM_001349277.2
BLAST PRIMER
NM_001349278.2
BLAST PRIMER
NM_001349279.2
BLAST PRIMER
NM_001349280.1
BLAST PRIMER
NM_001349281.2
BLAST PRIMER
NM_001349282.2
BLAST PRIMER
NM_001349283.2
BLAST PRIMER
NM_001349284.2
BLAST PRIMER
NM_001349285.2
BLAST PRIMER
NM_015199.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_001349278.2
Sequence length
7744 nt
GC Content
0.3886

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2060.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2210.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2398.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001349285.2 AGAUCUCUGGUAAGUGUAACAUGUGAGCAUUACUAGGCAUUUCAUCCUG… 1881 nt 0.3599
NM_015199.4 AUUGUGGAGUUUGGAUGCCGCCGCUGCCGCGGGCUGGAACGGCGCGGCC… 6607 nt 0.4179
Showing 11 to 12 of 12 entries
Summary

Predicted to be located in cytosol and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image