Basic Information
Symbol
LRBA
RNA Class
mRNA
Alias
LPS responsive beige-like anchor protein
BGL
LAB300
LBA
uc.147
LPS-responsive vesicle trafficking, beach and anchor containing
CDC4L
CVID8
lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein
CDC4-like protein
vesicle trafficking, beach and anchor containing
Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein
Beige-like protein
Location (GRCh38)
4:150264435-151015755
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001364905.1
Sequence length
10148 nt
GC Content
0.4244
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2938.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-3134.97 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
2949.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
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| NM_001367550.1 | AGCACUCGGCGCUGUCAUGGCGGCCGGGAGCAGCUUCAGUGGGCACACG… | 10335 nt | 0.4293 |
| NM_006726.4 | AGGGAAACUUGGAGGCUGCGACCAGGGUUUGGCGUUGUUGUCAGCCUCG… | 9914 nt | 0.4241 |
Summary
The protein encoded by this gene is a member of the WDL-BEACH-WD (WBW) gene family. Its expression is induced in B cells and macrophages by bacterial lipopolysaccharides (LPS). The encoded protein associates with protein kinase A and may be involved in leading intracellular vesicles to activated receptor complexes, which aids in the secretion and/or membrane deposition of immune effector molecules. Defects in this gene are associated with the disorder common variable immunodeficiency-8 with autoimmunity. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2012]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
