Basic Information
Symbol
LRP6
RNA Class
mRNA
Alias
LDL receptor related protein 6
ADCAD2
low density lipoprotein receptor-related protein 6
STHAG7
low-density lipoprotein receptor-related protein 6
LRP-6
Low-density lipoprotein receptor-related protein 6
Location (GRCh38)
12:12116025-12267185
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_002336.3
Sequence length
10252 nt
GC Content
0.4095
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2941.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-3148 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
2456.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
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| NM_001414247.1 | GUAUCCCUGCGCCGCUGCGCGAGGCAGAGGCUGAAUGAGGAGCUGCGCG… | 5301 nt | 0.4767 |
| NM_001414248.1 | GUAUCCCUGCGCCGCUGCGCGAGGCAGAGGCUGAAUGAGGAGCUGCGCG… | 5613 nt | 0.4719 |
| NM_001414249.1 | GUAUCCCUGCGCCGCUGCGCGAGGCAGAGGCUGAAUGAGGAGCUGCGCG… | 4990 nt | 0.4721 |
| NM_001414250.1 | GUAUCCCUGCGCCGCUGCGCGAGGCAGAGGCUGAAUGAGGAGCUGCGCG… | 5003 nt | 0.4717 |
| NM_001414251.1 | GUAUCCCUGCGCCGCUGCGCGAGGCAGAGGCUGAAUGAGGAGCUGCGCG… | 5136 nt | 0.4727 |
| NM_001414252.1 | GUAUCCCUGCGCCGCUGCGCGAGGCAGAGGCUGAAUGAGGAGCUGCGCG… | 5105 nt | 0.4772 |
| NM_001414253.1 | GUAUCCCUGCGCCGCUGCGCGAGGCAGAGGCUGAAUGAGGAGCUGCGCG… | 5416 nt | 0.4714 |
Showing 1 to 10 of 13 entries
Summary
This gene encodes a member of the low density lipoprotein (LDL) receptor gene family. LDL receptors are transmembrane cell surface proteins involved in receptor-mediated endocytosis of lipoprotein and protein ligands. The protein encoded by this gene functions as a receptor or, with Frizzled, a co-receptor for Wnt and thereby transmits the canonical Wnt/beta-catenin signaling cascade. Through its interaction with the Wnt/beta-catenin signaling cascade this gene plays a role in the regulation of cell differentiation, proliferation, and migration and the development of many cancer types. This protein undergoes gamma-secretase dependent RIP- (regulated intramembrane proteolysis) processing but the precise locations of the cleavage sites have not been determined.[provided by RefSeq, Dec 2009]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
