Basic Information

Symbol
LRRC15
RNA Class
mRNA
Alias
leucine rich repeat containing 15 LIB leucine-rich repeat-containing protein 15 hLib leucine-rich repeat protein induced by beta amyloid leucine-rich repeat protein induced by beta-amyloid homolog Leucine-rich repeat-containing protein 15 Leucine-rich repeat protein induced by beta-amyloid homolog
Location (GRCh38)
3:194355249-194369743 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001135057.3
BLAST PRIMER
NM_130830.5
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_130830.5
Sequence length
5881 nt
GC Content
0.5300

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2081.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2188.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1226.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001135057.3 ACACUCAUGCUGCAGCCUUGAGCCGUCCCUCGUCCUCCUCUCAGGCUCC… 5938 nt 0.5296
NM_130830.5 ACACUCAUGCUGCAGCCUUGAGCCGUCCCUCGUCCUCCUCUCAGGCUCC… 5881 nt 0.5300
Summary

Enables several functions, including fibronectin binding activity; laminin binding activity; and protein sequestering activity. Involved in several processes, including host-mediated suppression of symbiont invasion; negative regulation of protein localization to plasma membrane; and receptor-mediated virion attachment to host cell. Located in collagen-containing extracellular matrix and plasma membrane. Is active in apical plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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