Basic Information

Symbol
MAT2B
RNA Class
mRNA
Alias
methionine adenosyltransferase 2 non-catalytic beta subunit MATIIbeta SDR23E1 short chain dehydrogenase/reductase family 23E, member 1 methionine adenosyltransferase II, beta methionine adenosyltransferase 2B MAT-II Nbla02999 TGR methionine adenosyltransferase 2 subunit beta MAT II beta beta regulatory subunit of methionine adenosyltransferase dTDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose 4-reductase putative dTDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose 4-reductase putative protein product of Nbla02999 testicular tissue protein Li 118 Methionine adenosyltransferase 2 subunit beta Methionine adenosyltransferase II beta Putative dTDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose 4-reductase
Location (GRCh38)
5:163503114-163519558 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_013283.5
BLAST PRIMER
NM_182796.2
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_013283.5
Sequence length
2064 nt
GC Content
0.3895

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-551.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -594.8 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 551.63
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_013283.5 GAGGCCCGCGUCGAUCCUGGGUUGGAGGAGGUGGCGGCCGCUGAGGCUG… 2064 nt 0.3895
NM_182796.2 GGGUUUUUGUUUUUGUUUUUGUUAAGUAGUUAGUUCUACCAAAUAGUUU… 2293 nt 0.3838
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the methionine adenosyltransferase (MAT) family. MAT catalyzes the biosynthesis of S-adenosylmethionine from methionine and ATP. This protein is the regulatory beta subunit of MAT. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Nov 2012]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image