Basic Information
Symbol
MBL2
RNA Class
mRNA
Alias
mannose binding lectin 2
COLEC1
MBP-C
MBP1
MBP
collectin 1
mannose-binding protein
mannose-binding lectin (protein C) 2, soluble (opsonic defect)
mannose-binding lectin (protein C) 2, soluble
HSMBPC
MBL
MBL2D
MBPD
mannose-binding protein C
collectin-1
mannan-binding lectin
mannose-binding lectin 2, soluble (opsonic defect)
Mannose-binding protein C
Collectin-1
Mannan-binding protein
Mannose-binding lectin
Location (GRCh38)
10:52765377-52772784
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001378373.1
Sequence length
3561 nt
GC Content
0.3726
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-899.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-970.66 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
864.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((....))))))((.(((((((..((((...))))....(((((((.((((...))))......(((((((.(((....(((..((((.....(((.((((..(((.....)))..)))).))).....(((.(((........((((...))))((((.(((((........)))))))))..))).)))))))..)))..))).)))))))((..(((((((((((((((.....((((...(((...((((((......((((((.((....))..))))))((((((...(((..((((((...((((.....))))..)))))).....)))...)))))).((((((((((((((.((((..((((((.((((.((((.((((....((((....))))...(.(((..........))).).....)))).))))))))...((.((((.((((((.(((((((...(((.(((.(.....).))).)))....)).))))).))))).).)))).))))))))..)))).))))......(((((.((((((((((((....))))).(((((((((((.(((.((.((((....)))).)).....(((((((((((((((.(((((((((.......(((........))).....)))))))))......(((....)))(((((((((((...(((.((.(((((((((.............((((...(((((..............)))))...))))..((((....((((...((((......)))).....))))...))))....(((((((((((..(((((.............)).))).)))))))))))..)))).))))))).)))...)))))))))))))))))))((((............(((.(((....((((.((((((.......((((.(.(((.(((((...((.((((((((((((....)))))..((((((.((....)).))))))......(((.(((((....((((..(((((((((((.......)))))))..))))))))....))))).)))...))))))).))..((((..(((((((((((((........((((((.......(((((...((((((((((((..(((.....)))..)))))))).......))))....)))))(((((((((..(((((......)))))...)))))))))..........))))))........))))).)))))))).))))...((((((........((((.....)))).........)))))).....((((((.((.((((.(.((((((((((((((((((...(((.......((((((((((((((((((((...(((((...((.((((..............((((((.........))))))....((((((((((....((.((((((((((((((((((.((((.((.......)).)))).))))))..)))))))))...........))).)).....)))))))..))).....((((((((.((.(((((..............(((((((.....(((((.((.((((((.((...........((((((......(((....((((.....((.(((....))).))..))))...)))...)))))))).)))))).....((((((((((...((...((((((.((...)).))))))....))......))))))))))..))))))))))))))((((((((..(((.....((.....))....)))..))))))))..))))))).)))))))).((((......))))(((((.((((........)))).))))))))).))...))))))))).......((.(((.((.(((((.......))))).)).))).))......))))).)))))))))))...........(((((((.(((((.....))))).))))))).....((((((...(((((.((((......)))))))))(((((((((...(((....(((.((((((((.....(((((((....(((..(((...(((.(((.((((.....)))).)))..)))...)))..)))....)))))))..))))))))..))).)))....)))).)))))....((((((((((....((((((((((((((((.............))))))..))))))))))....)))))).))))..............))))))....(((((...((((((((((.(((((((((((((.((((((((...)))))))).)))))))))))))))))))))))...))))).........((((.......))))....(((((((((......))))))))).((((((.((.(((.....((.((((((((...)))))))).)))))..)).))))))((((....)))))))))))))..)))))))))))).)...)))).)))))))))))))))).))))))))))).)))).))))))....(((((.((.......)).)))))...((((((....)))))))))).((((((.......)))))).............................)))))))............)))))))))))))).(((((((((((((((((.....))))).((((.(((((((((((((((.(((.((..(((..((((......(((...((((........)))).)))))))..)))..))...))))))))).)))))).)))....))))..(((((............))))).))))))))))))....((((((((......(((.....)))......))))))))((((((.(((.((......))))).))))))...((((...((((((((((((.....)))))))....)))))...))))))))))))))))))))))))))...........(((((((.........))))))).......)))))).)))....))))..))))))))))).))))..)))))))))((((((.......((((((.........(((((........)))))................(((.((((((..((.....))..))))))..)))..)))))).......))))))((((((((((.(.((...(((.(((((((((((..(((....)))))))))........(((((((((((............))))))))))).......(((((.((((.......((((((((...........))))))))...)))).)))))))))).)))..)).).)))))).)))).(((((((...((((.((((.(((.....))).)))))))).....)))))))....(((((.......)))))(((......)))))))))).)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((.((..((((,..{(((((.((..((((...))))..))..))))))))))..)).)))).,,,(((((({,((((((..{{,{(((,,{,..(((.((((..(((.....)))..)))).))){{{.,{{(,((({,.....{(((,...||,|(((,{(((((........))))))))}.,,)).,,,)))),..,},,))),))}})})}}.,,{|||||||{|||||,,.,,((((.,.(((...{({(((.....{((((((.((....))..))))))|(((((...(((..((((((.{,({((.....)))),.)))))).....)))...)))))}.,{{((({((,((((.((((..((((((.((((.((((.((((....((((....))))...(.(((..........))).).....)))).))))))))...{(.((((.{(((((.(((((((...(((.(((.{.....}.))).)))....)).))))).))))).,.)))).)}))))))..)))).)))),}{,,{((((({((,((,,,,,||.}},})))).{((((((((({,((({((.(({{,,.,|||},||.||||{((((((({{({{((,(((((((({..,,,..,{|,,.,,,,,))).}},.}||||||||{,....(((....)))(((((((((((...(((.({((((((((((.....,{{.,...{((((((((((,..{..{,.....},.,,}..,,))).))))))}}..{{{{,,.{{{{......||||,,...}}}}..,)))},,..(((((((((((..(((,{,....},....,.)}.))).)))))))))))..)))).))))))).)))...))))))))))),,|||}||||,...}}}}.,,,..{((,(((..,.((((.(((((({.....,{(((.(,(((.(((((.,{((,(((((({(((((....))))}..(((({{.{{,...}}.)))))}.,,,,.{((.(((((....((((..(((((((((((.......))))))),.}))}))))....))))).))).,,}))))))..,..((((..(((((((((((((........((((({.......(((((...((((((((((((..,((.....)))..)))))))).......))))....))))){((((((((..(((((......)))))...))))))))}..........})))))........))))).)))))))).))))...((((((.,......((((.....)))).........)))))).,...((((({{((.((((.,.((((((((((((((((((..,{{,.......(((((((((((((((({{{,..,(((((...((.((((...,,.........((((((.........))))))....,,,{{(((((....((,{((,((((((((((((((.((((.{(,......)).)))).))))))..))))))))},.,,,..,.,.}}}.}}....,}}}}}}}..,}},,|,|({(({{{{.{{.{{{{{.....,.......{(((((((.....(((((.((.((((((.{{..........,((((((......(((....((((.....((.(((....))).))..))))...)))...)))))))).))))))}}...((((((((((...((...{(((((.({...}).)))))}....)}.,....))))))))))..,,))))))))))))|(((((((.,(((.,,.,{{...,.}},...}))..)))))))}..})))}}}.})))))}).|||{..,,,.|||}{{(((.((((........)))).))))))))},))...)))))}}},....,..{{.{||,||.{{(((.......)}))).}}.})),))......))))),}))))))))))......{{{({(((((((.(((((.....))))).)))))))....}}|||,,..,(((((.((((......)))))))))|,,,(((,,..,||,....,,..((((((((.{{..{(,,,,|..,,,||}}|||,..||{.,,,.,,(({{{..||||.,,,..,,},,.)}}}})))..,.}||||||..||,||||,..))),,))....))))}}||||..{{(({{((((((....((((((((((((((({.............))))))}.}))))))))).,..)))))),)))},,,,,,,|,.....||||||,{{.{((((...((((((((((((((((((((((((.((((((((...)))))))).)))))))))))))))))))))))...})))}....,,,,,{{{{,,,,,..}}},....(((((((((......))))))))).,,.,.,,,|,{{{.....{(.((((((({...)))))))).)},}}..,,.)))))).}}|....}))}}}}))))))..)))))))))))).}...)))).)))))))})))))))).}}}}))))))).)))),)))}}}....(((((.((.......)).)))))..,((((((....)))))))}))}},))))}}}}}}})}.}))||.|||.}}},.........{(((({..,.,,,,...}}}}}}.....}}}))))))))}}}||,|||||{{|,{{((((..,,.|}}},,{{,,,(((((((((((((((.,,,.,{..(((..((((......(((...((((........)))).)))))))..)))..,,...,},)))))).)))))).)}}....,,,,..|||,...,}}}||.,}}}.,}}|)))}}})))))},...,{{,{{{{......,||.....,,.......||||||,,((((((.(((.{(......))))).)))))).....||}}}|...((((((((.....)))))))}....,|||{{{,...,,,,))))))}}))}))))))}{{,..,|||..,|||||||,|,,|,..,}},|||{|,....}}}}}}.}}).,}}))),..}}))))))))}.)}}}..,|},,,|||((((({.......((((((.,.......{((((........))))}....,,......,...(((.((((((.,({.....))..))))))..))).,)))))).......})))))((((((((((.{.{{.,.(((.((((({(((((,,(((....)}})))))},.......(((((((((((...,........))))))))))).......{{(((.((({..,,{{,((((({{{..,.,,..,.,}})}})))}}))))).)))))))))).)))..)).,.)))))).)))).,{{{{{{...(((,{((((.(((.....))).)))))))),,{{,}}}}}},..,,},}..,,.,|,,.,||||||......}}}}},.,,,....
Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_000242.3 | ACACCAAGGUGAGGACCAUGUCCCUGUUUCCAUCACUCCCUCUCCUUCU… | 3521 nt | 0.3701 |
| NM_001378373.1 | AGAGGGCCAGCGUCCUUGUCACUGAGUCCCUGCUCUGCAGAAACACCAG… | 3561 nt | 0.3726 |
| NM_001378374.1 | AGAGGGCCAGCGUCCUUGUCACUGAGUCCCUGCUCUGCAGAAACACCAU… | 3576 nt | 0.3728 |
Summary
This gene encodes the soluble mannose-binding lectin or mannose-binding protein found in serum. The protein encoded belongs to the collectin family and is an important element in the innate immune system. The protein recognizes and binds to mannose and N-acetylglucosamine on many microorganisms, including bacteria, yeast, and viruses including influenza virus, HIV and SARS-CoV. This binding activates the classical complement pathway. Deficiencies of this gene have been associated with susceptibility to autoimmune and infectious diseases. [provided by RefSeq, Jun 2020]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
