Basic Information
Symbol
MEF2D
RNA Class
mRNA
Alias
myocyte enhancer factor 2D
myocyte-specific enhancer factor 2D
MADS box transcription enhancer factor 2, polypeptide D
Myocyte-specific enhancer factor 2D
Location (GRCh38)
1:156463727-156501266
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_005920.4
Sequence length
5912 nt
GC Content
0.5673
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2321.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-2419.01 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1439.6
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((((..((.(((.((((((((((..((((((((...(((((((....((..((((((.((((((..((((...(((.........))).))))..))))))((((((((((((....)).)))))).))))(((....)))))))))..))(((((((((((((((.((((((......(((((((((.((((((((....))))).((((((((....((...(((.(.(((((((.((....))))))))).)))).)))))))))).....(((((...))))).((.(.(((((........))))).))).....(((((..((((((((((.((((((((..(((((.(....).))))).........((.(((((.(((((((((((((((((((((((((((..(((((.......)))))........(((((.........))))).(((.....)))......((((((((((((.......)))))))..)))))........(((((((.....(((((.(((((((((.((((....)))).))).))).................))))))))..)))))))((((((...........))))))(((((.((((.....))))..)))))...(((.(((((((........(((.....)))...((.(((((.....((((((....(((((...)))))..))))))..(((((((...(((((((....((((...(((.(((((((((.(((((.(.(((((.(.(((((((((...)))))))))))))))..).)))..))))))).(((..........)))........(((((...)))))))))..))).))))..(((......)))...))))))))))))))((((((........))))))......))))).))....))))))).)))(((((((((((((.((((((..((((.((...)).))))((((((.((....)))))))).))))))...)))..))))))))))...)))...))))))).)))))((..(((((...((((((((((((((((.((.(((.(.(((((((((..((((.((((.....((((....(((((...((((.....))))......))))).....))))..............(((.....))).))))...))))..).))))))))))))))))))))....))))).)))))...)))))....))...........(((((((.(((.(((((((((..(((.........((((....))))(((.((..((((((..(((((((((((((((.(((((((...((.(((....))).))..((((.................)))).((((((.((((...........))))...)).)))).(((............)))...........((((((((((((.((((((((.......)))))))).)))))).......))))))..))))))).))))))(((....((((((((((.((((((....((((.(((((....(((((((((((..(((((.((....))............((((((.((((.((((((.......))).....(((((((((((((....))))))..((((((.(((((.(((((.((.......((((.........................)))).......)).))))).))))))))))).(((((....((((((......))))))..((((........))))...((((((....(((......)))......)))))))))))...))))))).)))))))))))))..(((((((...))))))))))))...(((((.(((...))).))))).)))))..))))))....((((((((((((...............((((........))))(((((.(((.(((((((...(((...(((........)))....((((((((((((.((((.((((((..((.((....((((((((((((((((.((((...(((((((.((.((((......))))(((((((.((.(((.......))).)).)))))))...............(((((((...(((((((((((((....)))))))..........((((((((((.......))).))))))))))))).....))))))))).)))))))...))))((.(((......))).))))))))))))))))))(((((....(((.((((((...((.(((((((.(((((((.....((((((((((((((....((((..((....((.......))...............((((.((((((((.(((.((........((((...)))))).)).).)))))))).))))))..))))...))).)).)).)))))))...)))).))).))((((((.(((((((.(((...)))))))))))))))).......))))).)))))))).)))...((((((((((((((.......)))).).....))))))))).(((((.....))))).))))))).))..)))))).)))).)))))))..))..))).))).))))))))))..)))))...(((((((((..(((((((((......)))))))))...(((((((((((((.((((((.((((.((((((((((((((((((((...((((((.......))))))((((((((((..((((((((..(.(((((.(((...(((((...........)))))..((((((........))))))))).)))))))))))))))))))).))))....(((.((((.((((((((.((((((.(((((((((.(((...))).).))))))))...))))))......(((..(((((((((..(((((.......))))).))).)))))).)))(((((.(((((....(((((((...(.(((((((((....(((((((....)))))))...)))))))))).)))))))...)))))))))).)))))))))))))))))))).))))))))...........)))))))(((...)))))))))....)))))))))..)).)))))))).)))))))))))))))))))............))))).)))).........(((((............)))))))))))..(((((...((...((((((......(((((((((((...((((((...(((.(.........).)))...))))))...)))))))))))..)))))).))..)))))..(((......))).))))))))))....)))........(((....)))...((((((.(((((((((.((.....)))))))))))..))))))((((((((((..((((...((((.((((((((.(((.(((....(((.((((((((((((((((((((((.....)))))))))))(((((((((((((((((....))))..))...))))))).((((...((((((...)))))))))))))).(((((.......((((((((((((((((((.((...))))))))))((((((.((((.(((((.(.((((((..(((((..(((.((......))...)))....))))).......))))))..))))))....((((((((....))))....)))))))).))))))....)))))))))).......((((((((....)))))))).))))).....(((((((.((((((..(((((((((((((((((((((.......(((((....(((((((((........)))))(((((.(((...((...((((((((.(.((((..((((((.((((..((.(((((((.........(((((((.(.(((.(((.....(.(.((..(((((.(((((.(((.(((.......)))))).)))))((((....)))).((((((((((((...(.((((((....)))..))))...)))))))......))))))))))..))))..))).)))))))))))..))))))).))..)))).)))((((((...((((........))))...)))))).((((........))))..((((((((......)))))))).)))..)))))))))))))...))..))))))))))))...)))))......))))..(((((..((((((.((((.....(((((...))))).......(((........(((((((((((((.....(((((((((.(((((........)))))))))..........)))))..(((((((((..((.......)).))))))))).......)))))))...))))))........))).((((((...(((((..(((((.....)))))..))....)))..))))))((((..(((.....(((.((((((((((((((........)))))))(((........))).)))))))...)))....)))..))))......((((...(((((((((.........)))))))))....)))).(((.((((((((....))).)))))..))).............)))))))))).)))))...)))).))))).))))).)))..))))))...)))))))(((((.....)))))...))))..))))))).)))))).)))..))))))).).)))).)))).))))))))))...)))))))))..))))))..)))))......))))))))).))).))))).)))))...)))).))))))))))))).))....))))))))....))))))))..))..)))))..((((((.....))))))(((((((....((....((((((((.....(((((((((.((((((.(((....)))..)))..(((.((((....)))).))).........((((.(((((......)))))...))))..(((((.(((((((............((((....))))..((..(((.((((((((((((((((((((.....))))(((.(((((.((((((.(((((.((((((.....((......)).(((.(((((((........)))).))).)))............(((((((((.(((.....(((((((((((..(((.((....)).)))..))))))))))).))).))))))))).....)))))).))))).)))))).)))))..)))...(((((((((((..((((.((((........)))).)))))))))))))))((((..(((.....((...........)).....)))..))))..))).))))))).)))))).)))..))((((((....))))))))))))).)))))))).)))))))))))))))))...)).)))))))))).)))).)))))(((((..(((((.((((((..........(((...)))..........)))))).)))))..)))))))))))..)))..))))..))))).))))))))))))))))))....)))))))))).))).)).)))))).)((((((((((((((..(((((((.....(((...)))..((((((((....))))))))..(((((....)))))......)))))))..))))...))))).....))))).((((.......))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.((((((..((.(((.((((((((((..((((((((,..{((((((.{{({({.((((((.{(((((..{(({...{{,...,}},.}))),))))}}))|)))((((((((((((....)).)))))))))))(((,,,{|||||||||..|}||{{||||{{{{||{,((((({......(((((((((.((((((((....))))).((((((((....((...(((.(.(((((((.((....))))))))).)))).))))))))))...,,(((((...))))).|{.(.(((((........))))).)}}.....(((((..((((((((((,{{{{{{{{{.(((((.{....}.)))))}..,,,,,,((.(((((.(((((((((((((((((((((((((((.,(((((.......))))).|,.....(((((........,))))).{{{..,.,|}}.,((,...|||{{,,,||,||{,{|}}..))))})||||,,,,.,..(((((,,..{{{({((({((({(((((.((((....)))).))).))).................}}}}))),.})))))))|||{((...........}|||}}(((((.((((.....))))..)))))..,{|{.(((((((......,,{({.....))).,.{(,(((((..,..((((((....(((((...)))))..))))))..(((((((...(((((((....((((...(((.(((,(((((.((((({,.(((((.{.(((((((((...)))))))))})))))...{||,,...,),))}(((...,.....,),,..}}}.,.|,|||}}},,,))))),..))).))))..(((......)))...))))))))))))))((((((........))))))....,.))))).))....))))))),)}}(((((((((((((.((((((..((((.((...}).))))((((((.((....)))))))).))))))...)))..))))))))))...)))...))))))),})))}((..(((((...((((((((((((((((.((.(((.(.((((((((,..((((.({{(.....((((,...(((((...((((.....))))......))))).....}}}}..........,,,.{((.....))}.))))...))))..).)))))))))))))))))))}...,)))))}}))))...)))))....)).......,...(((((((.(((.(((((((((..{((...,.....((((....))))(((.((..((((((..(((((((((((((((.(((((((...((.(((....))).)).,(((,...}}},..........||,|,((({{{.((((...........))))..,)),)))|{(((............}}.....})}}}..((((((((((((.((((((((.......)))))))).)))))).......))))))..))))))).))))))(((....((((((((((.((((((,{{.((((.(((({.,{.({(((((((((,,((,{{.{{....||.......||...((((((.((({{((({((,......}}),,...(((((((((((((....))))))..((((((.(((((.(((((.((.......((((.........,......||.......)))).......)).))))).))))))))))).(((((.{{,(({{{(.,,,,{|,||||..,((,{{{{{{{.,,,,..}|,||||}..}|,|}}}..)))),,....})))},))))).,,))))))).))))))))))))).,((((((,...}))))))||||,||,||||,.{{|.},))),))))).)))))..)))))){,(.((((((((((((......{{,,.....{(((..,,,,..||}}({{((.{((,((({{{{.,,||,|,.|||........))),..,({,(((((((((.((((.((((((..((.((...,((({(((,,((({,,({{(((,{{((((((({(....(({{{{{,.,||(((((((.{,.(((.....,.})}.}}.))))))}.........,,,{{.{((((,(...(((((((((((((....))))))).}}}}}},..((((((((((.......))).))))))).{{{{{{{{{,,,,})))))})))),,}.,,||||{{,({,...,.,)),)))))),,|||||||||||(((,.....|||},,(((({..((.((,((((.(,,,,|,}}}}.||,,,||,||||||}}}}||||}..,.,},||},.....)),,.......{{....((((.((((((((.{{(.{,........(((,...,))),),,,.),)))))))).))))....})}|,..}}|{||{||{||||||....))))})))})}|||{,{.|||||||,|||,,,))})))))))))),)).......|}}}|{|,}}}},,.)))...((((((((({((((.......)))).,.....))))))))).{{(({.....))}))),)))))).))..)))))).)))).))))))),.)).,))),}}}.}}||||||||,,|||||...(((((((((,.,.,{{,((,,{{,...,,|||({|...((((,((((((,,.({((((,((({{{((((((({((((((((((({,,((((((.......)))))}{{{{{(((((,,,{{(({({.,{,{,,,(,(((.....{{{{{{{.,,{{{{{,|||..(((({(,,,,,...||||}},,)})),))})))),},,)))))}},})),,,,|||.||||.||||||||.{(((({,(((({{((({{((,,,||}.|,|||||}}}.|.,}}))}...,,}|||}.(((((((((..(((((.......))))).))).)))))).)))|))))))}|..,,,,|{{{.{{..|(.((((,(({{{{{{(((((((....))))))}.}})))},))})))})),,))))))}))))})))}))))}))}})))}))))}}},))))))))))),,}}))),))))}}}|{|...}))}))))}..,})))}))))}.,)},.,}))))).})}}})}))))))))))))...,}},.....})))).))))...,,,...,{|||..,...},....,))),))))))..(((((.,.((...((((((....((((((((({((((((((((.((((((,.....}))))})))))..,))))...}))))))))}))...)))))).)),.)))))..,{,......}}}.))))))))))....))).....,..(((....)))...((((((.(((((((((,({.....)))))))))))..))))))((((((((((..((((...((((.((((((((.(({.(((....(((.((((((((((((((((((((((.....))))))))))){{({(((((((((((((....))))..))...))))))).((((...((((((...))))))))))}}}}.{((((.......((((((((((((((((((.((...))))))))))((((((,((((.(((((.{.(((((({,(((((..(((.{{......)}...)))....))))).,.....))))))..,)))))....((((((({....}))),...}))))))).))))))....)))))))))).....,.((((((((....)))))))).))))).....(((((((.((((((..((((({((((((((((({{{{.......(((((..,,((({(((((........)))))(((((.(((...({...((((((((.(.((((..(((.((({,,.{({(((.(.{.....((((.((((.(((((.(..((((..{{.(((((,,.((((({(((((.(((.(((.......)))))).))))).{,(,{..,|||.(((((((({{((,,{..|}}}}}...,|||...((({...||||,,.,}...)))).}}}.},}))))},))}.})).,..))))})),))))}.))..}))){{{(,(((((..{((({.,.,....))})}}},,))))),)))},.))))),.)))).)))).....,.)))))))))),)))..)))))))))))))...}}..))))))))))))...)))))......})))..(((((..(((((,{((((.,...(((((...})))}....,,,,{.....,,,.{{{((({{(((((,.,,,(((((((((.(((((........)))))))))...,,..,,.}}}))..|||((((((,.((.,,,,.,||,|}}}}}}},.....}.)))))}}..})))|||.,{,,...,,,,,||||,,,,.{{((..(((((.....))))).}))|,....,.,||},,,}}|}}})}}}}}}|,||.{{||{{((((((((........)))))))}........}}))}.,))),))...}}},.,||||.{{{{,{{{,..{{((...(((((((((.........)))))))))....)))}.||,.((((((((....))).))))).})),,})),........)))))))))).)))))...))))},)))).))}))},))..))))))...)))))))(((((.....)))))...))))..))))))).))))}),)})}.))))))).).)))}.)))).)))))))))))},)))))))))..))))))..)))))......}}})))))).))).)))))}}})))..,)))).))))))))))))).))....}}}}})))})}.)))))))}.,))..)))))..((((((.....))))))(((((((....{{....((((({((..{,.(((((((((.((((((.(((....)))..)))..{{{.{(({{,,,|,,,,)))},},.,,,,({{{.(((({..,...}}}}}...)))}..(((((.(((((({.........{{{(,,,....))))..,,..(((.((((((((((((((((((((.....))))(((.(((((.((((((.(((((.((((((.....({......)).(((.(((((((........)))).))).)))............{{{((((((.(((.....(((((((((((..(((.{{,....},)}),,))))))))))).))).))))))|}}.....)))))).))))).)))))).)))))..)))...((((((((((({.,(((.((((........)))).)))))))))))))))((((..(((,,({{,({......,}..))}.,..)))..))))..))).))))))).)))))).)))..}}((((((....))))))))))))).)))))))).))))))))))),))})))}})).)))))))))).)))).))))){((((..(((((.((((((..........(((...}))..........)))))).)))))..)))))))))))..)))}.})))..}))))}))))))))))))))))))....)))))))))).))).)).)))))).}{(({{((((({(((..{{{{{{{{,,.,((,...|||..((((((((....))))))))...||,..,|||||||,.....})))))),,))))...))))}....,}}}},.{({{.......))))....
Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001271629.2 | AUACCGUGUGCUCCCCUUGGCAAGUCGGUUCCUGUCCCUUAAGCUGAGA… | 5765 nt | 0.5632 |
| NM_005920.4 | GAGUUACCUUUGGAGCCCGAAAGGAGGAAGGAAGCAAAAUAUCAACAAC… | 5912 nt | 0.5673 |
Summary
This gene is a member of the myocyte-specific enhancer factor 2 (MEF2) family of transcription factors. Members of this family are involved in control of muscle and neuronal cell differentiation and development, and are regulated by class II histone deacetylases. Fusions of the encoded protein with Deleted in Azoospermia-Associated Protein 1 (DAZAP1) due to a translocation have been found in an acute lymphoblastic leukemia cell line, suggesting a role in leukemogenesis. The encoded protein may also be involved in Parkinson disease and myotonic dystrophy. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2012]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
