Basic Information
Symbol
MGA
RNA Class
mRNA
Alias
MAX dimerization protein MGA
KIAA0518
MAD5
MXD5
FLJ12634
MAX gene associated
MAX gene-associated protein
MAX dimerization protein 5
MGA, MAX dimerization protein
Location (GRCh38)
15:41621134-41773081
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001400225.1
Sequence length
12193 nt
GC Content
0.4323
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3515.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-3745.45 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
2965.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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| NM_001400246.1 | GUAUCCCGGCGUGCAUCGGGGAGCGCCCAAGGGCGAUGGUUCCCGGCUC… | 2063 nt | 0.4624 |
| NM_001400247.1 | GUAUCCCGGCGUGCAUCGGGGAGCGCCCAAGGGCGAUGGUUCCCGGCUC… | 1772 nt | 0.4345 |
Summary
Predicted to enable DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific and RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Predicted to be involved in cell fate specification and positive regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to act upstream of or within cellular response to leukemia inhibitory factor. Part of MLL1 complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
