Basic Information

Symbol
MKLN1
RNA Class
mRNA
Alias
muskelin 1 TWA2 muskelin 1, intracellular mediator containing kelch motifs muskelin Muskelin
Location (GRCh38)
7:131110096-131496632 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001145354.2
BLAST PRIMER
NM_001321316.2
BLAST PRIMER
NM_013255.5
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_013255.5
Sequence length
11136 nt
GC Content
0.3686

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2809 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -3042 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3202.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

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NM_001321316.2 GGCGGCCGCUACGGUGCUGACAAGAUGGCGGCUGGCGGAGCUGUCGCUG… 11139 nt 0.3686
NM_013255.5 GGCGGCCGCUACGGUGCUGACAAGAUGGCGGCUGGCGGAGCUGUCGCUG… 11136 nt 0.3686
Summary

Muskelin is an intracellular protein that acts as a mediator of cell spreading and cytoskeletal responses to the extracellular matrix component thrombospondin I (MIM 188060) (Adams et al., 1998 [PubMed 9724633]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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