Basic Information

Symbol
ANKS1A
RNA Class
mRNA
Alias
ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A KIAA0229 ankyrin repeat and SAM domain containing 1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1 ANKS1 ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 1A Odin ODIN Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 1A
Location (GRCh38)
6:34889243-35091421 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_015245.3
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_015245.3
Sequence length
6350 nt
GC Content
0.5513

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2384.34 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2494.3 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1567.4
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_015245.3 AGUGACGCGCUCGUGGGGAAAAGGCAGGGAGGGGGUGGUGUCCCCAGCC… 6350 nt 0.5513
Summary

Predicted to enable ephrin receptor binding activity. Predicted to be involved in ephrin receptor signaling pathway; neuron remodeling; and substrate-dependent cell migration. Predicted to act upstream of or within negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process and regulation of ephrin receptor signaling pathway. Located in cytosol and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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