Basic Information

Symbol
MMP10
RNA Class
mRNA
Alias
matrix metallopeptidase 10 matrix metalloproteinase 10 (stromelysin 2) stromelysin 2 SL-2 STMY2 stromelysin-2 MMP-10 matrix metalloprotease 10 matrix metalloproteinase-10 transin 2 Stromelysin-2 Matrix metalloproteinase-10 Transin-2 EC 3.4.24.22 EC 3.4.24
Location (GRCh38)
11:102770502-102780628 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_002425.3
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_002425.3
Sequence length
1759 nt
GC Content
0.4372

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-509 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -544.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 486.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_002425.3 AGAAGCCCAGUAGACAAAGAAGGUAAGGGCAGUGAGAAUGAUGCAUCUU… 1759 nt 0.4372
Summary

This gene encodes a member of the peptidase M10 family of matrix metalloproteinases (MMPs). Proteins in this family are involved in the breakdown of extracellular matrix in normal physiological processes, such as embryonic development, reproduction, and tissue remodeling, as well as in disease processes, such as arthritis and metastasis. The encoded preproprotein is proteolytically processed to generate the mature protease. This secreted protease breaks down fibronectin, laminin, elastin, proteoglycan core protein, gelatins, and several types of collagen. The gene is part of a cluster of MMP genes on chromosome 11. [provided by RefSeq, Jan 2016]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image