Basic Information

Symbol
MMP11
RNA Class
mRNA
Alias
matrix metallopeptidase 11 matrix metalloproteinase 11 (stromelysin 3) stromelysin 3 SL-3 ST3 STMY3 stromelysin-3 matrix metallopeptidase 11 (stromelysin 3) stromelysin III Stromelysin-3 Matrix metalloproteinase-11 MMP-11 EC 3.4.24.- EC 3.4.24 EC 3.4.24.24
Location (GRCh38)
22:23768226-23784322 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_005940.5
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_005940.5
Sequence length
2261 nt
GC Content
0.6192

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-985.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1023.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 754.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_005940.5 AAGCCCAGCAGCCCCGGGGCGGAUGGCUCCGGCCGCCUGGCUCCGCAGC… 2261 nt 0.6192
Summary

Proteins of the matrix metalloproteinase (MMP) family are involved in the breakdown of extracellular matrix in normal physiological processes, such as embryonic development, reproduction, and tissue remodeling, as well as in disease processes, such as arthritis and metastasis. Most MMP's are secreted as inactive proproteins which are activated when cleaved by extracellular proteinases. However, the enzyme encoded by this gene is activated intracellularly by furin within the constitutive secretory pathway. Also in contrast to other MMP's, this enzyme cleaves alpha 1-proteinase inhibitor but weakly degrades structural proteins of the extracellular matrix. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image