Basic Information
Symbol
MMP3
RNA Class
mRNA
Alias
matrix metallopeptidase 3
matrix metalloproteinase 3 (stromelysin 1, progelatinase)
stromelysin 1
CHDS6
MMP-3
SL-1
STMY
STMY1
STR1
stromelysin-1
proteoglycanase
transin-1
Stromelysin-1
Matrix metalloproteinase-3
Transin-1
EC 3.4.24.17
EC 3.4.24
Location (GRCh38)
11:102835801-102843609
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_002422.5
Sequence length
1822 nt
GC Content
0.4495
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-541.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-575.99 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
408.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_002422.5 | ACAAGGAGGCAGGCAAGACAGCAAGGCAUAGAGACAACAUAGAGCUAAG… | 1822 nt | 0.4495 |
Summary
Proteins of the matrix metalloproteinase (MMP) family are involved in the breakdown of extracellular matrix in normal physiological processes, such as embryonic development, reproduction, and tissue remodeling, as well as in disease processes, such as arthritis and metastasis. Most MMP's are secreted as inactive proproteins which are activated when cleaved by extracellular proteinases. This gene encodes an enzyme which degrades fibronectin, laminin, collagens III, IV, IX, and X, and cartilage proteoglycans. The enzyme is thought to be involved in wound repair, progression of atherosclerosis, and tumor initiation. The gene is part of a cluster of MMP genes which localize to chromosome 11q22.3. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
