Basic Information
Symbol
MNDA
RNA Class
mRNA
Alias
myeloid cell nuclear differentiation antigen
PYHIN3
epididymis secretory sperm binding protein
Myeloid cell nuclear differentiation antigen
Location (GRCh38)
1:158831332-158849506
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_002432.3
Sequence length
1716 nt
GC Content
0.3782
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-389.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-422.58 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
400.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_002432.3 | AGUGUAAGAAGGCCAUCUACAAUCAAGAUUGAGAGUGGCUCUAACAAGU… | 1716 nt | 0.3782 |
Summary
The myeloid cell nuclear differentiation antigen (MNDA) is detected only in nuclei of cells of the granulocyte-monocyte lineage. A 200-amino acid region of human MNDA is strikingly similar to a region in the proteins encoded by a family of interferon-inducible mouse genes, designated Ifi-201, Ifi-202, and Ifi-203, that are not regulated in a cell- or tissue-specific fashion. The 1.8-kb MNDA mRNA, which contains an interferon-stimulated response element in the 5-prime untranslated region, was significantly upregulated in human monocytes exposed to interferon alpha. MNDA is located within 2,200 kb of FCER1A, APCS, CRP, and SPTA1. In its pattern of expression and/or regulation, MNDA resembles IFI16, suggesting that these genes participate in blood cell-specific responses to interferons. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
