Basic Information

Symbol
AP4E1
RNA Class
mRNA
Alias
adaptor related protein complex 4 subunit epsilon 1 AP-4-EPSILON SPG51 adaptor related protein complex 4 epsilon 1 subunit CPSQ4 STUT1 AP-4 complex subunit epsilon-1 AP-4 adaptor complex subunit epsilon adaptor-related protein complex AP-4 epsilon epsilon-adaptin Adaptor-related protein complex 4 subunit epsilon-1 Epsilon subunit of AP-4 Epsilon-adaptin
Location (GRCh38)
15:50908672-51005895 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001252127.2
BLAST PRIMER
NM_007347.5
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_007347.5
Sequence length
6743 nt
GC Content
0.3902

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1827.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1965.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1449.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001252127.2 AGUGCCUACGGAGGCCGGGCCGGCAGCGGCGGCCGGGCAUGAAGCCGGG… 6766 nt 0.3900
NM_007347.5 AGUGCCUACGGAGGCCGGGCCGGCAGCGGCGGCCGGGCAUGAAGCCGGG… 6743 nt 0.3902
Summary

This gene encodes a member of the adaptor complexes large subunit protein family. These proteins are components of the heterotetrameric adaptor protein complexes, which play important roles in the secretory and endocytic pathways by mediating vesicle formation and sorting of integral membrane proteins. The encoded protein is a large subunit of adaptor protein complex-4, which is associated with both clathrin- and nonclathrin-coated vesicles. Disruption of this gene may be associated with cerebral palsy. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2011]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image