Basic Information
Symbol
MUC12
RNA Class
mRNA
Alias
mucin 12, cell surface associated
mucin 11
MUC-11
MUC-12
MUC11
mucin-12
mucin-11
Mucin-12
Mucin-11
Location (GRCh38)
7:100969431-101018940
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001164462.2
Sequence length
16366 nt
GC Content
0.5495
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4019.55 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-4288.89 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
3846.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001164462.2 | AUUUCUUGGUCCCUCCUGAUGAGAGAAGAUGGGCAGCCAGGGGCCCGUU… | 16366 nt | 0.5495 |
Summary
This gene encodes an integral membrane glycoprotein that is a member of the mucin family. Mucins are O-glycosylated proteins that play an essential role in forming protective mucous barriers on epithelial surfaces and have been implicated in epithelial renewal and differentiation. These glycoproteins also play a role in intracellular signaling. This protein is expressed on the apical membrane surface of epithelial cells that line the mucosal surfaces of many different tissues including the colon, pancreas, prostate, and uterus. The expression of this gene is downregulated in colorectal cancer tissue. [provided by RefSeq, Apr 2017]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
