Basic Information

Symbol
MUC13
RNA Class
mRNA
Alias
mucin 13, cell surface associated down-regulated in colon cancer 1 mucin 13, epithelial transmembrane DRCC1 MUC-13 mucin-13 RECC Mucin-13 Down-regulated in colon cancer 1
Location (GRCh38)
3:124905440-124953819 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_033049.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_033049.4
Sequence length
2879 nt
GC Content
0.4467

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-805.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -865.02 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 709.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_033049.4 AUCAUUUCCUCCUCAGAUUACCAAGCAAGAACAGCUAAAAUGAAAGCCA… 2879 nt 0.4467
Summary

Epithelial mucins, such as MUC13, are a family of secreted and cell surface glycoproteins expressed by ductal and glandular epithelial tissues (Williams et al., 2001 [PubMed 11278439]).[supplied by OMIM, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image