Basic Information
Symbol
MUC22
RNA Class
mRNA
Alias
mucin 22
PBMUCL1
panbronchiolitis related mucin-like 1
mucin-22
panbronchiolitis-related mucin-like protein 1
G4
Mucin-22
Panbronchiolitis-related mucin-like protein 1
Location (GRCh38)
6:31010474-31035402
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001395414.1
Sequence length
6019 nt
GC Content
0.5390
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1833.17 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1936.61 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1553.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001198815.1 | ACAAAAACUAGCUGGCGUGGUGGCAGGCACCUGUAGUCCCAGCUACGUG… | 6005 nt | 0.5394 |
| NM_001318484.1 | ACAAAAACUAGCUGGCGUGGUGGCAGGCACCUGUAGUCCCAGCUACGUG… | 5970 nt | 0.5405 |
| NM_001322469.1 | ACAAAAACUAGCUGGCGUGGUGGCAGGCACCUGUAGUCCCAGCUACGUG… | 6000 nt | 0.5407 |
| NM_001395414.1 | AAAAAAGAAGAAAAAUAAGAAGCCAAACUGUGGAGCAAUUUGGGGGCUC… | 6019 nt | 0.5390 |
Summary
Predicted to be located in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
