Basic Information
Symbol
MUC7
RNA Class
mRNA
Alias
mucin 7, secreted
FLJ27047
MG2
mucin MG2
mucin 7, salivary
mucin-7
MUC-7
apo-MG2
salivary mucin-7
Mucin-7
Apo-MG2
Salivary mucin-7
Location (GRCh38)
4:70430492-70482997
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_152291.3
Sequence length
2363 nt
GC Content
0.4088
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-441.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-488.8 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
541.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001145006.2 | ACUCAAUUACAGUAUUUCCUAUUCCUAAAAGAAUCUAGUAGGAAGGCUA… | 2541 nt | 0.4054 |
| NM_001145007.2 | ACUGUUCCACUACUCAUCAAGCACAUAAGUUACUCAUUGAGAACCUCUG… | 2480 nt | 0.4073 |
| NM_152291.3 | CUCUUCUUUUGCUUCUAGUUACCAUCCUCAAAGGAUUGGCUAAAAGCAA… | 2363 nt | 0.4088 |
Summary
This gene encodes a small salivary mucin, which is thought to play a role in facilitating the clearance of bacteria in the oral cavity and to aid in mastication, speech, and swallowing. The central domain of this glycoprotein contains tandem repeats, each composed of 23 amino acids. This antimicrobial protein has antibacterial and antifungal activity. The most common allele contains 6 repeats, and some alleles may be associated with susceptibility to asthma. Alternatively spliced transcript variants with different 5' UTR, but encoding the same protein, have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2014]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
