Basic Information

Symbol
APOLD1
RNA Class
mRNA
Alias
apolipoprotein L domain containing 1 FLJ25138 DKFZP434F0318 BDVAS VERGE apolipoprotein L domain-containing protein 1 vascular early response gene protein Apolipoprotein L domain-containing protein 1 Vascular early response gene protein
Location (GRCh38)
12:12725917-12829975 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001130415.2
BLAST PRIMER
NM_030817.3
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_030817.3
Sequence length
4594 nt
GC Content
0.4549

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1514.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1604.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1102.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001130415.2 AGUGUGCAGGCAGGCGGGGGUGCGCGGGGCGGUCAGCGAUCUGCAGCUU… 4738 nt 0.4639
NM_030817.3 AGAUUUUACUUUCCUGGAGGCAGACAGAAGUGAAUGGGAAUGGAGAGGC… 4594 nt 0.4549
Summary

APOLD1 is an endothelial cell early response protein that may play a role in regulation of endothelial cell signaling and vascular function (Regard et al., 2004 [PubMed 15102925]).[supplied by OMIM, Dec 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image