Basic Information

Symbol
MYBPC3
RNA Class
mRNA
Alias
myosin binding protein C3 FHC cMyBP-C myosin-binding protein C, cardiac CMD1MM CMH4 LVNC10 MYBP-C myosin-binding protein C, cardiac-type myosin binding protein C, cardiac Myosin-binding protein C, cardiac-type Cardiac MyBP-C C-protein, cardiac muscle isoform
Location (GRCh38)
11:47331406-47352702 UCSC Genome Browser

Secondary Structure

MANE Select
NM_000256.3
Sequence length
4217 nt
GC Content
0.6080

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1795.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1862.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1098.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_000256.3 AGUCCCUCUUUGGGUGACCUGUGCCUGCUUCGUGCCUGGUGUGACGUCU… 4217 nt 0.6080
Summary

MYBPC3 encodes the cardiac isoform of myosin-binding protein C. Myosin-binding protein C is a myosin-associated protein found in the cross-bridge-bearing zone (C region) of A bands in striated muscle. MYBPC3 is expressed exclusively in heart muscle and is a key regulator of cardiac contraction. Mutations in this gene are a frequent cause of familial hypertrophic cardiomyopathy. [provided by RefSeq, May 2022]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image