Basic Information
Symbol
MYCBP2
RNA Class
mRNA
Alias
MYC binding protein 2
PAM
KIAA0916
FLJ10106
PHR1
PAM/Highwire/RPM-1 protein 1
MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase
Myc-bp2
Phr
E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2
Highwire
RING-type E3 ubiquitin transferase MYCBP2
myc-binding protein 2
protein associated with Myc
Myc-binding protein 2
Protein associated with Myc
EC 2.3.2.33
Location (GRCh38)
13:77042474-77327094
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_015057.5
Sequence length
15077 nt
GC Content
0.4424
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4515.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-4798.09 kcal/mol
Frequency:
1.04e-199
Diversity:
3483.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_015057.5 | AGCUUCCCAUUGCGGGUAGCCCCGGCGGUGGUGGCGGUGGUAGCGGUGG… | 15077 nt | 0.4424 |
Summary
This gene encodes an E3 ubiquitin-protein ligase and member of the PHR (Phr1/MYCBP2, highwire and RPM-1) family of proteins. The encoded protein plays a role in axon guidance and synapse formation in the developing nervous system. In mammalian cells, this protein regulates the cAMP and mTOR signaling pathways, and may additionally regulate autophagy. Reduced expression of this gene has been observed in acute lymphoblastic leukemia patients and a mutation in this gene has been identified in patients with a rare inherited vision defect. [provided by RefSeq, Mar 2017]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
