Basic Information

Symbol
MYH11
RNA Class
mRNA
Alias
myosin heavy chain 11 SMMHC SMHC SMMS-1 myosin, heavy polypeptide 11, smooth muscle AAT4 FAA4 VSCM2 myosin-11 epididymis secretory sperm binding protein myosin, heavy chain 11, smooth muscle KIAA0866 Myosin-11 Myosin heavy chain 11 Myosin heavy chain, smooth muscle isoform

Secondary Structure

MANE Select
NM_002474.3
Sequence length
6880 nt
GC Content
0.5519

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2396.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2513.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1960.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((((((.((((((((...((((...((((((.(((((((.(((((((((((((((.(((((((((((((((((.((((((((.((..((.(((.....(((((....(((((..(((((((.((.((((..((.(((((((((((.((((...((((((....((((.(((((((((.....)))))))))....((((((((((((((((.(((((.((((((..((((((((((..((..(.....)..)).......(..((.((((((.(((((...(((((....((((......)))).(((.(((........((((.....))))..))))))((.((((((((...)))))))).))((((((((..(((......))).)).)))))).........((((((((........))))))))...........(((.(((..(((((((((....((((...............))))(((((...(((((((.((...)).))))...)))...))))))))))))))..))))))))))).....))))))))))).))..)...))))..)))))).))))))....))))).)))))((......)).....))))))))))).(.((((((...((.(((...(((.....)))..))).)).)))))))((((.((...))..))))..))))...................(((((((((((......)))).))).........))))..(((((((((...(((....(((......((((.((........)).)))).....)))..........(((((..((((..((((...((((....(((((...........((......))...........)))))(((.....))).))))...)))).))))...(((((..((((((.........(((.(((((((....(((((.((((......)))))))))....))))))).))).....(((((((((((.((((.....(((((.(((..((((((((.(((..((..((((((((.(....).)))))..)))..))))).))))))...))..))))).))).....))))......(((((((...((((.((((.(((((.(.....((((((((.....(........)......(((.(((((((((..(((..(((((((((((.(((((((...(((((((.((((......((((......))))((((((((...((((..(((((.(((....))))))))..))))(((((((((.((((.(.........).)))))))).)))))..(((....)))(((((...........))))).((((..(((...((.((((.(.(((..(((((((......((....)).....)))))))..)))))))))))))))))......))))))))...)))))))))))))))..)))))))))))))).)))...........((.((((((((.((((((((((..((.((...(((((.((((((.((.(((((....(((((((..((((.((...((((((((..((((....((((((......))))))....))))((((...)))).................((((.((((.(((((((((((.((.....)).)))).......(((((((.......))))))).....(((....))))))))))))))))))..)))))))))).))))..)).))).........(((((.((((((((((.(((.........))).)))))..........(((((((((..((.(((......)))...((.((.....)).))((((((((((((.....((.(((((((....(((((((((((.((((((...((.(((((.(((((((...((((..........))))..)))).)))..((((...((((((((..((((..(((.......(((.((((((((...))))))))))))).)..))))..)))))))))))).....))))))).))).......((((...((((((((((((..((.(((((.((((.(.(((...((((((....))))))...)))))))).(((((((..(((((((((....(((((((....)))))))((.(((((((((...(((.(((((.(((.((((((((((((..((((((((..((((.......(((((((((.....((.((((((....(((((.((..((((((((....))).))))).........((((((...((((.............)))).))))))...((...((((((((((...(((((.(((((((((.((....)).)).))..((((....)))).((.(((....))))).((((((((((..((.((...(((.(((((((......(((.(((((....))))).)))..((((.((((.....))))..)))).....(((((((((((.((((..((((.(..(((.((((((((((.....((((((....)))))))))))))))).)))..).))))..)))).((...(((((..((.......))..))))).....))..)).))))).)))).............(((((...)))))....(((..(((((((((.((..((..((.......((((...))))..(..(((((.((((........)))).)))))..)))..)))).)))))))))..)))..))))))).)))......((.((......)).)).......)).)).))))))))))..........))))))))))(((((...)))))...)))))))))).))(((((....))))).)).)))))......))).))))).....)))))))))....(((((((.((((((..((((..(((....)))..))))......(((((((.((((((((((((((....)))))))...........................((((....))))((((((..((.(((.........((((....))))........))).))..))))))..((.(((........))).)).......)))))))....(((((((.(((((................)))))......(((((....(((....(((...)))...)))....))))).)))))))..(((.....)))..)))))))(((.....)))....)))))).)))))))((((.....((...((((.((((((....(((((((((((.(((.((.........(((...........(((((........(((((...)))))..(((.((((((...((((...))))..(((((((..(((((((((.((((.......(((((...((....))......)))))......)))).)))))..........((((..((.....))...)))).......((((...(((.(((((((((.......((((...(....)..))))......))))))))............).)))..)))))))).))))))))))))).)))....((.(((....)))))......((((...))))..(((((.....))))))))))..(((....)))...........(((....))).)))........))))).)))))))))))..)))))).))))...)).)))).))).)..))))))))..............))))))).)).))).).)).((((((.......))))))..))))))))..)))..))))))))....((.((((((((...((((.........((((((((((......((((.(((....((.((((.(.....(((((......))))).....).)))).))....)))))))((((((.((....)).))))))(((((.(((........(((....))).......)))..)))))..((((((((((.......((((......))))....)))))))).)).(((((((..(((....(((...)))....))).)))))))..............))))).))))).........))))...)))))))).)))))))))))..)))))))....))))).)).(((((((..((......))..)))))))...)))).))))))))....))))((((((..........(((......))).....((((((((((....)))))).).)))(((((((......)))))))))))))...((((.(((..(((((......(((((..((.......))..))))).(((..((.........((((.(((........))).)))).........))..)))...(((((((((..(((..........))).))))))))).((((((.........(((((((.((.....(((.....(((((...........)))))....((.....))....))).....)))))))))....(((((((......))))))).((((((....))).))))))))).......))))..)..))).)))).....(((((.....))))).))).)).)))))))))..))))))).))......))))..)))))))).))..))))))))).)))))))))).....))..)))))..)))))))).)))))...)).))....))))))....))))...).))))))).)).))))).))))...)))))))))))((....))...((.((((..(((((.............)))))..)))).))..........).))))).))))))))...)))))))..)))))))))))(((((.(((...((((..(((...))).))))....))).)).)))...))))))..))))))))))))).)))))))))))))))...))))))))).....((...(((((.......((((....))))........)))))....))..)))))))))))).)).)))))))..)))))........(((..((((((..(((....((((((((.....)).))))))..))).)))...)))..))).(((......)))..))))))))))..))))))))))..)))))))).)).))).)))).))))....)))).))).)))))))...))))...))))))))))...))......))))))))))(((((......)))))((((....(((((.(((((((((.............(((((((.(((..((.(..(....)..).))..))))))).)))..(((((.....))))).))))))).........................)).)))))...))))......(((((((.((..((((((....(((((((((((((.((((....((((((......))))))......((((((......((((..((..(((((((.((..((.....))..)))))))))..))...))))..((((.(((((.((.((.(((((.((((((((.(.....(((.....)))((((((((((.((.(.(((....)))).)).((((....((..(.((((....)))).)..)).....)))).((((.((........)).)))).((((..(((.......))).)))).......((((((((((((...(((...((((..(((.(((.(((((...))))))))))).))))...)))..........(((...(((((((((...(((((...(((..((....((((.(((........))).))))...))..)))..(((((((((((......)))).........................................................((........)).)))))))........)))))...))).))))))....)))...............(((......))).................))))..)))))))).............(((((((.((((.....(((...((((((((((.((((((((........((((((((........))).(((...))).(((.......))).(((((((.((..(((..((((((((((.......)).))))))))))).)))))))))....(((((...))))).))))).......)))))))))))...((((..((....)).))))........))))))).)))))))..)))))))......((....)).............)))))))))).......(((((.(((......((((....)))).....))))))))(((...)))).))))))))....)))))..(((((...(((((.............((((.(((...))).)))))))))..))))))).))..)))))...))))......((((((...........)))))).))))))....))))))))))))).............((((..........))))(((((....(((.......)))..)))))...((((((((......))))))))...))))...))))))....)).).)))))).........................))).))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.(((((((((((({{(((((({{.,{((((...((((((.(((((((.(((((((((((((((.(((((((((((((((((.((((((((.((..(,,(((.....(((((....{((((..(((((((.((.((((..{,{(((((((((((.{,,,...((((((....((((.(((((((((.....)))))))))....((((((((((((((((.(((((.((((((..(((((({({{.{{(........||.{{.{..{({{,.(((((((({((((.{((.(((((....{(((......)))}.,,,{({{........{{{|,....}})}..})))))((.((((((({...}))))))).))((((((((..(((......))).))}}))))))),.)))},((((((((,{.....}))))))))...........{{{.(((..(((((((((....((((...............))))(((((.,.(((((((.((...}).))))...)))...))))))))))))))..)))}}))))))))),.))).}.)).)).,......}))}}.,)))))).))))))....))))).))))),{......,,..,..))))))))))).{.((((((...((.(((...(((.....)))..))).)).))))))}((((.((...}},.))))..)))).......,,....,,.,,.(((((((((((......))))}})).........))))..(((((((((,,,{((({..(((..,...((((.((........)).)))),.|,.))).......,{{{{,{{..,,,{,..{{{,{{{{{,...,}||||{,|{{..,..||,|,,,,.,|||||.||.....,,{{(((..,,.}||.,{{{,,,|,,({({{|,,.,{{{.{{(({{{..,....,{.{((.(((((((....(((((.{(((......)))))))))....))))))}.}},.....(((((((((((.((((,,...(((((.(((..((((((((.(((,,({..{(((((((.(....).))))}..}})..},})),))))))...))..))))).))),,,,.}}}}......(((((((...((((.((((.((((({(.....((((((((.....{........,.....,{{(.(((((((((..(((..(((((((((((.(((((((...(((((((.{{,..,....|{{,.{{,,,||||((((((((,{{{(((..(((((.{((....))})))))..)))}(((((((((.((((.(.........,.)))))))).)))))..(((,,,,}}}(((((...........))))),(((((.((.......|)|))).))},,|||||{{{{,...,.{{{,..||.,,||}}}}}||}}}},)))},})),))),....}))),,}))}}}))).)))))))))))..)))))))))))))).)))...........{{.((((((((.((((((((((..((.({...(((((.((((((.((.((((({{{.(({{(,({{{{{,.||}.,|||,||||,,((({....({((((,,....||||||,{,,||}}((((.,{}|||............{{{,,((({,(((((((((((((({(,,(,,,{,||,|||}|,{...,(({{(((,.,,{{{|||}|}|{,..{(({.{{.,|||||,|||,,,,,,))}.,,))))),},.)),).,)).|))|.,,}}.,,||}|{.||||((((((.(((.......,,))).)))))).......{{({(({{(((.{({.(({......|||,{{,{|{..,,{.|,.||({(((((((((({{...{({((((((,....{((({((((({.{{((((...{{.(((((.(((((((...((((..........))))..)))).)))..,{{(.{{((((((((..((((...,{.......(((.((((((((...))))))))))),}.,..))))..))))))))))),.....))))))).}}},...{{{((((,..{{{({((((((({{,{.((({{.((((.(.(((...((((((....))))))...)))})))).,{|||{,..,||||||||,..,|||||{|,,..}||}}}}||.(((((((((.,,((((((((,.{{||.{(,((((((((..((((((((..{(((,......{{|||||||,....((.((((({..,{((((,.,,..,{|||||.{{{{{,|{|||||{{,......((((((...((((.............)))).))))))...{{,..((((((((((...{{(((.(((({((((.((....)).)).))..|,{{,,..}}||,{(.,{{.({.({{.{(((.,,|}||,}}}|}{||||{({.(((((((,,....{{|,|{|||,,,.|||||{}}}.||||.|||(|.,,,.}}}}.|}}}}.,,..((((({({(((.((((..((((.(..(((.((((((((((..,{,(({(((....)))))))))))))))).)))..).))))..)))),||...|||||.,|{.,..,..}}..))))}.....))..}}.))))).))}}...,|......,.(((((...))))).,..(((..(((((((((.((..((..({.......((({...))))..(,,(((((.((((........)))).)))))..))),.))}).)))))))))..))).,)))))}).}})}}},,}|}}}}}))}}.,)))})}}}})),)})))}}}})}},))}}}.,}....|||||,||||(((((...||||}...,},,,,,,,}}})|{|||...,))))).))})),.},,,..}))),)))}),}}}}))))))}))},,,(((((((.((((((..((((..(((....)))..))))......(((((((.,{,(((((((((({....}}}}}}}............|{.............((((....))))((((((..((.(({.........((((....}})),...,...})}.))..))))))..{{.(((........))).}|.,.....}}})))}....{(({{((,(((((................))))).}...,((({{...,|||....,{{..{|||,..},}....))))).})))))).}|.|.},}},},..)))))))(((.....)))....)))))).)))))))||||,....||,}}|||{,(({{{|||,{(((((((({{({((({((((...}))).}}}..........((,(({,.,..,.((((({..{{{{{{{,,{..,,,,,.,.||||}}},....))))))}}}}}.}}(((((.((((...,...(((((...((....))......)))))......)))).)))))........,.((((..{{.....}}...)))).},||}.{|||||..}.))||||||||......,||||}},|}}.,)|.}|||......)))}}|||.{.......,|,||||}},|||}|}|,.})))}},},,,}|,}}},,..,|,|||,...))},)}|,|,,||||,..,}}}..)))}}}).})))}.,}))))}.{((....)))...........|||,.,,,))}}}}........,||,|.|||||||,|||{.|,,,,).)))).}}))}))}}.,)).}..}})}},,}..........,..}))})}}}}||.)))}},}}.||||{{,|,,.,,)})))),,))}}||||.{||||,||||},||....{(,({{{{(((...{(((,{,,...,..{{{{{{((({{{...{({{|({({,{.,,((((,.,,,,..||||,,,,,,,}}}))..,||||}|||||}},|,.{||||(((((({.((,,,,}}.}||||||{({{.....},..,,,})},..||||}...||}}}}.,}.||||{((((((((((....{{.((......}))).)....)))))))).}}.(((((((..(((....(((...)))....))).))))))).,||||..|||||,|||||{{},|||......,.,|||{,.|}}}}))),}}))}|||||}..}||||||..,,||||,.,,.(((((((..((......))..)))))))..})}}}.}}}}}||}....}}},((((((..........(((......)))....,((((((((((....)))))).).)))(((((((......)))))))))))))..|||||,{{(,.,{{{|......,,{{{,.{,..,,|,.}}.,}}}},.|||||{{,,.....,.||||}||{.....,,,}}},}}}|.||,,||,|||,.|||.,.{((((((((.,,((...,....,,))).)))))))))}((((((.......,.((((((..{{,...{{(|..}}}(((((...........}))))...,{{,...,||....}}}|}}}.))))}}}}}....(((((((......))))))).((((((....))),,)))))))}{{{....)}}},}),.}))}}}}....},|||||....,)))))},)),)},|||}},}))..}})}))),))}...,}))))}}))),)))).,..})}}})))))..)))))})))}....,,,.,))))..)))))))).)))))...)).)).,,,)))}}}....))))...}.))))))).}).))))).))))...)))))))))))((....))...((.((((..(((((.............)))))..)))).))........,}}.))))).))))))))...)))))))..))))))))))),|||{.||..{|((,{..{{,..,))).)))),.}}))},)}.}}}}},..,,},)}))),.),))))}},))))))))))))))}.{{|||||,,,,}.,}}}}}..{(({{.......((({....))))........))))).,..)),})))))))})))).)).)))))))..))))|((......))|..((((......)))).((((((((.....)),})))))..}||{{{.{{,.||....}.|||}..}}}},}..))))))))))..))))))))))..)))))))).)).))),)))).})}),...}))).))).)))))))...))))...))))))))),..}))......)))))))))){((((......)))))((((.,..(((((.(((((((((.............{((((((.,{{,|(({,..{....,..}.,},,))))))).))}..|||{{.....}}}}}.)))))))...,,,,..,,......,,.,,,,,}),))))).,.))))......(((((((.((.,(((((({{{.(({{((((((((({(((,..,.{(((((......)))))),.....((((((......((((..((..(((((((.((..((.....))..)))))))))..))...))))..{(((.(((((.{{.({.,{{,,.(((((((({({..({((((..(..({((((,,,((,(((.(.{((...,|}},.|}.,.||..}}}|..}},|,,..}}))))..)..)})))),.))}((((.((........)).)))).,{{({{{{{,{{{,...,),))}..,.}}..((((((((((((...(((,,.{{{{,,{{||(({{(((((...})))))))}}}.}}}},,.}||......,.,.{(({|,(((((((({...(((({...{{{..((....{(({.(((........))).)))}...}}..,}},,{{{{(((((((......))}},........................................................((........)).}})))),.,,.},..)))))...))).)))))).,{{||................{{{......,)),,,.......,,.....))))..))))))))...,.........(((((((.((((....,{{,...{{{(({{(((.((((((((........((((((((........))),(((...))).(({.,....}))).(((((((.((..(((..((((((((((.......)).))))))))))).)))))))))....(((((...))))).,)))).......)))))))))))..||,,,..{|...,||{}},.....}}}})}))))),},,)))}..))))))).....,||....||.........,,,,}}}}|||}}},......|||||||||,,,...|||,|||||},,....,),.,}}},(((...)))}.)))))))).,,})}}},..{((({.{|(((((.............((((.(((...))).))))))))),.)))))}}.}}..)))))...)))).....,|{|||{.,|..,,,.,,))}))}.))))))...})))))))))))))...,,,|{||...((((..........)))){||||,..}{{,.......}}...,},}}.,.((((((((......))))))))...))))},.)))))}.,..)).).)))))).......................,}))}.,}))))....

Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001040113.2 GAGAUUUGGACGCUCCGGCCUGGGAGGUGCGUCAGAUCCGAGCUCGCCA… 6940 nt 0.5523
NM_001040114.2 GAGAUUUGGACGCUCCGGCCUGGGAGGUGCGUCAGAUCCGAGCUCGCCA… 6901 nt 0.5518
NM_002474.3 GAGAUUUGGACGCUCCGGCCUGGGAGGUGCGUCAGAUCCGAGCUCGCCA… 6880 nt 0.5519
NM_022844.3 GAGAUUUGGACGCUCCGGCCUGGGAGGUGCGUCAGAUCCGAGCUCGCCA… 6919 nt 0.5524
Summary

The protein encoded by this gene is a smooth muscle myosin belonging to the myosin heavy chain family. The gene product is a subunit of a hexameric protein that consists of two heavy chain subunits and two pairs of non-identical light chain subunits. It functions as a major contractile protein, converting chemical energy into mechanical energy through the hydrolysis of ATP. A chromosomal rearrangement involving this gene is associated with acute myeloid leukemia of the M4Eo subtype. Mutations in this gene are associated with visceral myopathy, megacystis-microcolon-intestinal hypoperistalsis syndrome 2, and familial thoracic aortic aneurysm 4. [provided by RefSeq, May 2022]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image