Basic Information
Symbol
MYL3
RNA Class
mRNA
Alias
myosin light chain 3
CMH8
VLC1
MLC1V
MLC1SB
myosin, light polypeptide 3, alkali; ventricular, skeletal, slow
myosin, light chain 3, alkali; ventricular, skeletal, slow
MLC-lV/sb
VLCl
CMLC1
cardiac myosin light chain 1
ventricular myosin alkali light chain
ventricular myosin light chain 1
ventricular/slow twitch myosin alkali light chain
Myosin light chain 3
Cardiac myosin light chain 1
Myosin light chain 1, slow-twitch muscle B/ventricular isoform
Ventricular myosin alkali light chain
Ventricular myosin light chain 1
Ventricular/slow twitch myosin alkali light chain
Location (GRCh38)
3:46835109-46885911
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_000258.3
Sequence length
885 nt
GC Content
0.5672
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-328.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-343.9 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
182.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((((((((((..((((((((.((..(((((((.....(((((((((.(((((..((..(((((((.(((((.((.((....(((((..((.(((.....)))(((....)))((((((...(((((((.((((.(((((((..((((.((((((((((((.(((........)))))))))))).....(((((((..(((((..(((...)))..)))))..))))))).((((((.(((.((.((((........))))))..)))..)))))).))).))))..))))))))))))))....((((.......(((((.(((.(((.((((.(((.((..((.(((((((...((((..(((......)))...))))...))))))).))..)))))........(((........)))..)))))))....))).))))))))).)))).)))))).((((......))))))..))))))).)).))))).))).)))).......))..)))))...)))).....))))))))).))).)).)))))).))..))((((((((((.(((..((((((..(((.(((.....))).)))..))).).))..).)).))))))))))......))))..)))))))..)))((((((((.(((((((.(((((((..((((((.(((..((((....)))).((..((((((.(((..(((.......)))..))).)))))).))...(((((.((((....)))).).))))(((......)))......((((((((..(((....)))..))))).)))....)))..))))))....))))......)))))))))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,((((((((((((((((..((((((((.((..(((((((.....(((((((((.(((((..{,..{((((((.(((((.{,.{(,.,.(((((..((,(((,,...||}{({....}}}((((((...(({{(((.((((.(((((((..((((.(((,{,{(((((.{{....,,}}}}}},}}},,,}}.....{((((((..(((((.,(({...}}),,)))))..))))))}.((((((.(((.((.((((........))))))..)))..)))))).))).))))..))))))))))))))..,{({,,.,.||,....((|({{.((({(((||((,{((..((.(((((((.,.((((..(((......)))...))))..,))))))).))..)))}}........{{{.......,)))}}).))))){{{{{{|...})))))).)))).)))))|{((((.....,))))))..)))))}),)).))))).))).)))).,,....})..)))))...)))).....)))))))))},)).)).))))))},)..))((((((((((.(((..((((((..(((.(((.....))).)))..))).)},)..).)).))))))))))......)))).,)))))))..)))((((((((.(((((((.(((((((..((((((.(((.,((((....))))|((,.((((((.(((..(((.......)))..))).)))))).}}...(((((.((((....)))).).))))(((,....})))......((((((((,,,,....,}}},,))))).)))....)))..))))))....))))......)))))))))))))))))).
Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_000258.3 | ACCCUGCUUUCUGCAUUCUUCUCUCCACAUCCCUCUCUGUACUUACAGC… | 885 nt | 0.5672 |
| NM_001406937.1 | ACCCUGCUUUCUGCAUUCUUCUCUCCACAUCCCUCUCUGUACUUACAGC… | 1014 nt | 0.5730 |
| NM_001406938.1 | CUCCGCAGCCGCCGACGCGGGAGUGUGGAGAGGCCGAGAGGAGCCUUCC… | 1157 nt | 0.5895 |
| NM_001406939.1 | CUCCGCAGCCGCCGACGCGGGAGUGUGGAGAGGCCGAGAGGAGCCUUCC… | 1039 nt | 0.5871 |
| NM_001406940.1 | AAUGUGACUUCAGCAAACACUCAGCAGCACUGCCCUGGCCCUGUGCUGU… | 789 nt | 0.5691 |
| NM_001406941.1 | AAUGUGACUUCAGCAAACACUCAGCAGCACUGCCCUGGCCCUGUGCUGU… | 1074 nt | 0.5680 |
Summary
MYL3 encodes myosin light chain 3, an alkali light chain also referred to in the literature as both the ventricular isoform and the slow skeletal muscle isoform. Mutations in MYL3 have been identified as a cause of mid-left ventricular chamber type hypertrophic cardiomyopathy. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
