Basic Information

Symbol
MYLK
RNA Class
mRNA
Alias
myosin light chain kinase MLCK smMLCK MYLK1 MLCK1 KRP Telokin MLCK108 MLCK210 MYLK-L smooth muscle myosin light chain kinase kinase related protein myosin, light polypeptide kinase AAT7 MMIHS MMIHS1 MSTP083 myosin light chain kinase, smooth muscle kinase-related protein Myosin light chain kinase, smooth muscle Kinase-related protein EC 2.7.11.18 EC 2.7.11

Secondary Structure

MANE Select
NM_053025.4
Sequence length
10113 nt
GC Content
0.4861

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3337.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -3524.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2471.1
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.(((((.(((((..(((..(((((.((((.(((((....))))).))))..)))))..))).)))))))))).)))((((((.(((..((((.(((((...))))).))))..))))).))))((((....))))..........((((((((((.(((((((.((..................(((((.((((((...((.(((.((((......)))).))).)).....)))))).))))).(((((......)))))...)))))))))))))).....................((((((((....(((((((((..((.((...))..))..)))))))))....(((((.((((((((....((((....((...((((((((((((..(((..((((((((.....(((((((.((((((..(((((.......)).))).((((((((((.((((...((((((((((((((((......))))))...((.((((((.(((....((((..(((.........(((.(((((.(((....)))..))))).)))(((((((((((..((((((..((((((.....))))))....))))))))))))..((((((...(((((((..(((((((..((((((((((((((..(((((((((.(((..((((...(((((.((((((((..((....)).))))))))))))))))).........))).)))))))))...((((..((((.((((((...)))))))).))..))))...((((((....))))))((((((.(((((((((.....((((..(((......))).))))....)))))).))))))))).........))))))))))...((((((...)))).)).....(.((.(((.(((((.((((.(((....)))))))))))).))).)).)....(((((..(((......)))..)))))))))...))).)))))))))))..))))))(((((....))))).((((((((.....((((.(((((...))))).((((((....)).))))..(((((...(((...(.((((..(((.........)))...)))).)...)))..)))))..))))....)))).)))).(((((.(((((.(((..............))).))))).)))))..(((((....)))))(((((((((.....).))))).))))))))..))).))))...)))..)))))))).)))))))))).))))((((((((((....(((((((((((..(((.............(((((.((((((((....((((.....)))).....))....)))))))))))...........(((((((((.((((..(.(((((.((((..(.((.(.((((...((((((((((((...)))))..)))))))((..(((.((.((.((..(((((((..((((((((((((..(((....)))..))))))).....))).......))..))).)))).....)))).)).)))..))........((((((((.((((....)))).))(((((((..(((..(((......))).))).)))))))(((((.......((((.((..(((.(.(((((((............))))))).))))..)).)))))))))(((...)))((......))))))))(((......(((......))).......)))..(((((((((.....))))))).)).(((....)))..)))).).)).)..)))).))))))))))))))))))).))))))))))))))..))))....).)))))(((((((.((((((..((.((((....)))).))..))))))...))))).)).(((((((.....)))))))....((((((((((.(((((((.((((((((((((.(((.....(((.......))).))).)))))).((((((.(((....(((((((((...(((((.....))))))))))))))..((((((((((((.(..((((((((((..(((.((((.(((((.((((........)))).))))).)))).(((..((.((.(((((..........))))))).))..))).))).....)))))))))).).))))))....((((((.........((((((........))))))))))))...))))))...((((..((((.(((.....((((((........)))))).......))).)))).....((((.(((.(((.((((...)))).)))..))).))))..((((....(((.(((((((....(.((.(((....))))).)))))))).))).....))))....(((.......))).))))))).)))))).........((((((((((((((((((((...((((((..(((((..((((((.((.((((..(((((((..........))))).))..)))).))))))))(((........)))...)))))))))).)...))))).(((((((((.(((..(....)..))).)))))...)))).......(((((((((((((((.((.((((......))))...))..))))))))........)))))))))))))))).(((.......))).(((.(((.((((((((.....)))))).))))).)))..)))))).)))).)))))))))))))..)))))).))))))))))...((((......)))).)))))).((((((((((.((......))..))))))))))...........)))))))....)).)))))).))).)).)).))))))))))))))...)))))))))))))......((((((.(((((((((((((..((....))(((.(((((((((((.((.((((((.............(((((((((.(((((..((((((((..((...))....))))))))..((((.(((((...(((.......)))..((((...)))).((((..((((((((((..((.((.....))..))..)))))).)))).))))(((......((((.((....)).)))).((((((....))))))....)))......((((((((.(.(((.......))).).))))))))..............)))).)..))))(((((((((..(..(.((((...(((((..((((((((..((((((.....((..(((.(((.((..((((((((..((((......((((((...((...(((((((..........)))....))))...))...)))))))))).))))))))....)).))).)))..)).....)).))))......)))))).))......((((((.......((((((....))))))...(((((.(......).)))))..........................(((.((..((((....)))).)).)))..((((...))))..)).))))...))))).)))))..)..))))))))).......)))))))))))))).....((((..(((.....)))..))))...((......))..............)))))).)).)).)))))).))))))...))))))))))))).((....((((...))))...))....((((.((((....)))))))).........))))))..((((((....))).)))..))))))))((((.((((((((((((.(((((((.(((((((((((.............(((((...((((....)))))))))(..((((((((((((((((((.((((((.((....(((..(((((((((.....((((((...((((....)))).((((((.............))))))(((....)))....(((((.(((...(((((((.....((((((((((..(((.....)))..)))).....(((((((...(((.....)))..)))))))..((((((.....((((((......(((((....(((((((..((......(((((((.....))))))).....)).))))))).....)))))(((((.....((((((((((...(((...(((((((..(((((.(((((((((..((.(((......(((..((((((...)))))).)))....((((.((((((((((((((((.(((((((.((((((((.((((..((((((((((((((...(((((((...(.....)...)))))))))))......(((((.((((((.((.((........))))....)))))).)))))........)))))))..)))...))))..(((((((((((((.......))))))))))))).)).)))))).)))))))......((((((..(((((((.......))).....))))...).)).)))..))).))))).))).........)))))))))(((((.((((......))))))))).(((((........)))))))).))))))))))).))))).......((((((((...........))))))))..(((((...((.........))...))))).((((((((((((((((...((.((((((...............))))))))(((((.................)))))((((((((((......))....))).))))).((((((.....))))))............(((((((((((....(((((..((...(((.....)))...)).)))))(((.((((...(((.....)))..)))).).))..((((.((((((((.(((.((.((..(((((.....)))))......((((((((((...((.....)).))((((((.((((.(((.((((.....)))).)))((((.((((((.((...)).))))))))))(((((.(((((.((...(((.((((((((..(((((.....)).))).))))...((.(((((....(((.....)))..)))))))...(((...(((((....))))))))...(((((((.((((((.....))).))))))))))((.(((.....))).))..................))))..)))...))))))).)))))..(((((....))))).....))))...)))))))))))))).....((((.((((((...)))))).))))...........)).)).))))))).))))))))(((..((.((((((.....((........))....)))))).)).)))....))))).))))))(((((((((.((((((((((.(..(((..(((((.....(((((...(((.((((((((((.(((......)))...))))).....))))).)))....(((..((..(((((....)))))..))..)))))))).....)))........(((((((.(((((((..((((((((((.....))))(((...(((((((((.....))))).))))...)))((((((((........((((((((....))))))))))))))))..(((.((......))))).(((((((((.....(((..((((.((((((((.......))))))))((((.(((.((((((......)))))).))).))))..........))))..))).))))))))).....(((((((((((...((((((((((.........((.((((((((....)))))))).)).........)))((((((((((((((((....))))))..((.((((((((((((((((((((.(((....((((..((((....((((((((.....)))))..............(((((.(((((((((((.((((...................((((((....((((...)))).....))))))((((((.(((...(((((((((((((((((.(((.((.((((.....)))).))))).)))).))).))))))))))..((((((.(((............)))))))))((((((.......))))))..........)))))))))..))))))))))))))).)))..))........(((((.(((((((....(((.............)))....))))).)).))))).((((..(((....)))...))))...(((((((.(((.((((....(((((.(((((....)))))))))))))).)))......(((.((((((......)))))).)))..((..((((....)))).)).))))))).(((((.....)))))...)))....))))...))))))).))))))))))))))).))))).)))))))))))).........)))))))...))))))))))).))))))....))))))))))))))....))..))))))).))))...((((((((((..(((.(((..................((((((..(((((((....((((((((((((..(((((((((.........)))))))))...))))......))).....................((((((((((...((((((((((.((((.....(((((((.((((........)))))))).)))...)))).))))).))))).....)))))...((((....))))..((.((((....)))).))....))))))))))...))))))).))))))........(((((..((((.......)))).)))))))))))..))))))))))...))).))))))))).............))))))))((((((.....)))))).(((((((........)))))))...........))))))))......................)))))))....)))..(((((((.(((((...(((((((........(((....(((((((((((((((((((((((((..(((((((........((((.........))))......((((.((.((...((((((.......))))))..)).)).)))).......................((((........))))..............((((((((((((((...))))))))))))))(((((((((((..((((...(((........))))))).......((((((.(((((((.(((.(((.(((..........(((((((.....((....(((((.(((((...))))).)))))...........))....)))))))......((((......))))((((((....(((((((......(((((((....................((((((.(((((.....((((..(((....)))...))))......))))).))))))...))))))))))).)))..)))))).((.(((((((.....(((...(((((....(((((((((.....((((((...(((((((((.........)))))))))))))))(((((....))))).....))))))))).......(((.((((((((((..((..((((((.........)))))).....((((((((((.(.((..((((((.......)))))).)).).)))))).))))..))..)))))))))))))..((((((((((((..((((.((.(((.((((((.....)))))).))).)).)))).))))))...)))))))))))))).....))))))).))((((((........))))))...))).))).))))))))))..))))))...((((((((........))))))))(((..(((.((((((((((((...))).((((((..........(((((....((((((((..((((((((.(.(((..((........))..)))...).)))))))).......((((((((.....((((((.(((.(((.(((((((((((((((((..((((.(((((.(((....((.((.(((....))))).))))))))...)).))))...)))).......))))))))..))))).))))))((((((.......))))))...........)))))).....))))))))))..))))))((((((((((((.(((.(((((.....((((((((......))))))))(((((((((...)))))))))...............))))).)))))))))))...))))................))))))))))).(((((((........)))))))..(((((((((((..(((.....))))))))))))))((((((...((....(((....((((......))))....))).....))...))))))..................(((((((....))))))).))))))))).)))..))))))))))))))...(((((((((((.....))).))).))))).)))))))((((.((...((((((..((((((((((((.((......))..(((((.....))))).(((((....)))))....))))))))))))...(((((....))))).....))))))...))))))...))))))))))))))...))))....)))))))....))).........))))))).))))))))))))..............))))))))))...........((((((((.......)))))))).....)))))....................(((((((...))))))))))))).....))))))((((....(((((.....)))))....))))(((((.......(((.......)))........)))))....(((((((......(((((((....)))))))..((((((.(.(((((((.....)))))))...)...))))))......(((...((((((....)))))))))...((((..(((((((.....))))))).)))))))))))...))))))....)))))))..))).)))))............((((((....))))))..)))))).........(((((.((.(((((......)))))))...))))).........((((....)))).......(((....)))..((((.(........).))))))))))......(((((((....))))))))))...)))...)).))))...)).)))))))))).))))))))..).)))))))...((((((....))))))((((..(((((..(.(((((.(((((((.((((.((((((((.(((....))).)))))....((((.((......)).)))).......(((((((((((((...))))))))...))))).......))).....)))))))).)))...............))))).)..)))))..)))).......)))).))))))).)))))).........(((((((.((...((((((((((..((((((.......))).)))(((((..((((((((((((((.......))))))))))...))))..))))).....................(((((((......((((.(((((............)))))))))(((((((.................)))))))......))))))))))))))))))).))))))).)))))).))))...))))).......(((((((((......))).))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((.(((((.(((((..(((..(((((.((((.(((((....))))).))))..)))))..))).)))))))))).)))((((((.(((..((((.(((((...))))).))))..))))).))))((((....))))..........((((({,,,,.(((((((.((....,..........,{.(((((.((((((...((.(((.((((......)))).))).)).....)))))).))))).|,(({{|....},,)}}},}}))))))),||||......,...,..........((((((((....(((((((((..((.((...}),.))..)))))))))....((({((((((((((....((((....,{...((((((((.,,,...((.((((((((((......((((((..,,((..(((((.......)),,))..))...((((.({{({...((.((.((.(((....))).)).))))...}))).))))........)))))).........)))))))))).}}(((.(((((((((((((...,(((((((((((..((((((..((((((.....))))))....))))))))))))..{(((((...(((((((..(((((((.,((((((((((((((.{(((((((((.{((..,..,,.((((((.((((((((..((....)).))))))))))))))})).........}}}.))))))))}.,.((((..(({(.((((((...)))))}}).))..))))...((((((....))))))((((((.(({((((((.....((((..(({......}}).))))....)))))).}))))))))......,..))))))))))...,{(((,...}))).})....{(.((.(((.(((((,({((.(((....)))))))))))).))).))})....(((((..(((......)))..))))))))),..))).)))))))))))..)))))|(((((....))))),{(((((((...,.((((.{((({...})))}{((((((....)).)))},}{((((...(((...{.((((..(((.........)),...)))).,...)))..))))}..)))),...))))}}))).(((((.(((((.(((....,,......,,))).))))).)))))..(((((....)))))(((((((({.....),})))).)))}}}}}.{{|(.{....((((((((((.((.(((((({,(((......)))...,........)))))))))...)))},))))))....}.)))),...))))))...})))))).)))(((..((((((..((((((((((((((.(((....(((((((((.((((..(.(((((.((((,,{.((.(.((((...{((({{{{(((({{{|||||{{|||||},......({(((,{((({..{{||{{.,|,{{,{{{((({,,(((.,,,|||,.||||}}}.....}}}}...,,{{{{.{||..{{{((...,{,.}}.)))...}}....,,..,||.||,}}||{{...,||,..{((((((((..(((..(((......))).))).))))))))}|),},.|,,,|{||.|{,.((,{(.(((((((........,...))))))).))|)|.||.}}}}{{(({((({....{((......))).})))))).,,..,|||,|}.,}}}}}.},,}})}}.}))})))))),)})),.,}|||,},,}))}.}}))},.)))).).)).),.)))).)))))}))))))))))))).....)))))))))((((((((....,((((((((....((((((...((.(((((..,((((.((....)).))))|((.{((({(((((((,.,,,||}}}))}}},|}|||,,(((((.......))))),|,(((,,{((((((.(((.......}}}.|{({(((,{{{{((,,.,(({....(((((((((,.,({{{{...,,)))}))))))))))..,|,{|.|||{{|||,.,{{{{{,{{,...,,.((((.(((((.((((.{......)))).))))).)))).|||..,|}|,.}}))|.,,,}})))),))))))|{|{{||{...{{{,,,|}}|||,|||,,,||||||{{{{.,{,{{,,,}|||||,|{{||..,,,...)))}||((((.(((((((......{{((,......)))..,))))))).))))}},))))))).)))})}))}.)))))),),)))..,||.|,|.|||}}}}.)))))))).))...)))))).,..)))}...)))))..)))))))){(((....)))}..))))))))))))))..)))......(((({....,(((((((.,{,(({{,...,},|,..,(((((((,.((.....((((((({((((({..(((((((..(((((.((((((((((((((..{(({{(((,.(((((....(((((.....(((((.(((..((((((..(((((((((.(((...,.{{.(((({...}))))}){{{{{(,{(((((((((..((.(((..(,...(((((......)))))..}}.,..))).))..))))))))).,}},}}}}}}})).))))}}))))..}}..,,..})))...))).))))))))))..,.)))))))))))).},,,))))))},.{{|...))),)))))).)))))..((.(((.((((((((.,.....)))))))).))).)).,.((((.....)))).....)))))))...)))))))).)))))...))))))))).}..)).,}))))))))..))))})))))))),)))))...)))))))))))))......((((((.(((((((((((((..((....))(((.(((((((((((.((.((((({.............(((((((((,{((((..((((((((,.{(...}}.,..)))))))).,{{{,,{((((.,.(((..{{,..|||..,{{(,..}|||.,{{,|,|{|{{{{|||.,||.||,....)),})),,}}}})).||||,}}}|(({......((((.({....}).}))),((((((....))))))....))}......((((((((.(.(((.......})).).)))))))).}..........,.)))),}..|||}(((((((((..(..(.((((...(((({.,(({(((((,.(((({{.|,,.,({,(({.{{{.{{|,{(((((((..((((......((((((...((...(((((((..,....,..)))....))))...))...)))))))))).)))))))),,|,}}|)}}.}||..,}|,,,,|}.},,},,....})}))).))......||,{||.......{(((({....}))))}...(((({.{......}.))))),,..},},,....{,........}}.(((.((..((((....)))).))}))}..(({{..,))))..,,,}))).,.))))).)))))..)..)))))))))}},....)))))))))))))).....((((..(((.....)))..))))...||......,,.............,}))))).)).)).))))))},)))))...))))))))))))).{(....((((...))))...},....((({,((((....)))))))).........))))))..(((((,....,))})))..))))))))((((.((((((((((((.(((((((.((({(((((((,.,,,....}}..(((((...((((....))))))))){,.((((((((((((((((((.((((((.((....({{..{(((((((({,...((((((...((((....)))).((((((.............))))))(((....)))....(((((.(((...(((((((.....((((({((((..(((.....)))..)))).,{{.(((((((...{({.....}}}..)))))))...}}|,,...(((((((((((,..(((((.{..(((((((..((......(((((((.....))))))).....)).)))))))....,)))))(((((.....({(((((({{...,{{.}}||||{{{..(((((.(((((((((..((.(((,.....(((..((((({...}))))).)))....((((.((((((((((((((((.(((((((.((((((((.{{,,..((({((((((((((,,.{{{{{||,},|,....|...}}})))))})),.....(((((.((((({.,,.((........)},),...)))))).))))).,|,....)))))))..))}...,,,,..(((((((((((((.......))))))))))))).}).)))))).)))))))......{{(({{..(((({{{.......})).....))))...}.)),.}},.))).))))).))}........,)))))))))(((((.((((......))))))))).,((((........)))))))).))))))))))).))))).,{{,...,,||||({{,.,,{{{.{((((((....))))))}.,,...,.....}}...,}|}|{((((((((,..((((((,((((((((({......,{{,..,{{||||||{.(((((...,,....,,,.,...)))))((((((((((......))....))).))))),|||{{{,,,,,)}}}}}.....(((((.((((((((((((.,.{(((((,,,{.,.(((.....))).}.)).)))))|,|.{{{(,,.(((.,,,.}}),,}))).).}}..((((.((((((((.(((.((.((..(((((.....)))))...,..(((((((({{...{{,....},.}}((((((.((((.(((.((((.....)))).))}((({{((((((.((...)).))))))))))(((((.((((({{(..,({(,((({{(((,,(({{{.,,,,)).))),)}}}...{(.(((((....(((.....)))..))))))}.,{(((...(((((....))))),)}..,|((((((.((((((.....))).)))))))))|((,(({.....))).)}...||....,,......,))))..))),..})))))).))))){.(((((....))))),....))))...))))))))))))))..,..((((.((((({...}))))).))))...........)).)).))))))).)))))))),((,.((.((((((.,,..{{........)},,..)))))).)).,,),...))))),,))))))))))).{{.((((((,,,{{{(((((({,{(((.....(((((...(((.((((((((({.(((.{....})}}}}))))).....))))).)))....(((..((..(((((....)))))..))..)))))))).....}))........{{{{(((,{{{({{{||((({{{,,{({{||,}}}}{{|}}.{((((((((.....))))).)))}...}||.,{{{((({{(((,,((((((((,..{{||}||||||,{((((((((((,((...,,,|||||,{,.,{{{((....}}.((((((..(((((.(((({{(,....})))))).))))).})),|||..|,|}))))}.|},.,,||.,,{{{{{|{|({|,.|||.||||||,,,..,,,|{{{{{{((((({.,({((,,.,....||...}||}|||{{{{{,,..}}))))))|))||{{...,,||.((((((((((((((((....)))))),.((.((((((((((((((((((((.(({.,.,({{({,((((..,,{{{(((({.....))))).,,,,.........{{{((.(((((((((((.((((...................((((((....((((...)))).....))))))((((({{(((..,((((((((((((,{(({.(((.((.((((....,}))).))})}.)))}.))).)))))))))),.((((({{(((............)))))))))((((((.......)))))).,,,.,....)))))))))..))))))))))))))).))}..}}........(((((.(((((((....(((.............))).,..))))).)).))))).((((..{{{....}}|,|{|||}...{{{{{||,|||,(((,...{(((((.(((((....)))))))))))})),))),,,,}.(((.((((((......)))))).))).,{{..{(({....)))}.||,|}}}}}}.(((((.....)))))..,))))...))))},.})))))).)))))))))))))))}})))).))}))))))))){{.{{{{...,,,,.)}}},)),}})},,..}}}}},.,,,))))))))},,,))}}}}}||.}}})),}}}}}||,,((((((((((..(((.(((,.......,|,||,....((((((..(((((((....{({((,,.((((.,(((((((((.,.......)))))))))...))))..,,.,|||,.........|||}.,,..,,|{||((((({.,,{{{{{{{{{{.{{{{,{,.,,(((({(,({{{.,,.,,},,)}}}}}}.|||||,}})).})))}.}}}},..,}.))))}}..{{((....)))}..,{|||,,..,,,,,..}},}}})),}})))))...))))))).))))))...},,..(((((..((((.......)))).)))))}}))))..)))))))))}.....}}})}}},,,,,......,,,....}}}..,.||{{{{.,,,.}))))}.||||,||}}}}}}},,,)))))},|}......,))))}))}..,,,.,,,........,,}},)}}||||,...||}..,{((((.,{{||{...(((((((......,.{{{..,.{{{{{(((((((((((({{{{((((,,{,.,.{{,,,.,,,,{{{{........,||||.....,(((({(({(({,.(((((,..,,...}}|||||,||,||,|||..,,.{,,,................(((({.{(({,((((({..,,,{{{{,.(((((((((((((({...})))))))))))))).....,,,,,,,}......,)))}..)})))))))}....,...{(((((...((((.{{......)).))))....)))))).........{{.,,,,(((({((((,...|||||{,}}}}....,,,,,,.||,...||||||},.....|||,,,.,,.|,{{((((((.,,.(((((((....,,{{.(((({{,...,}}}}}},|||...((((((.(((((.,,..((((,.(((....))).,.))))...,,.))))).))))))..|,}},,,,}}}).))),.))))))}}}},))})|))}},|(((....))}}...,||||{||||,,,..(((((,..|{{||||||{||||...,.)))))}},||||,,,(((((....)))))...}}))}}}}}}}.,...,}}||,,(((((((((..,(..((((((.........)))))).....((((((((((.(.....((((((.......))))))....,.)))))).))))..,,..)))))))))|((({.{{{..(((((((..((((.((.(((.((((((.....)))))).))).)).)))).)))))))...}}}.))))),|||{{{.{|||.|,..,|((((((|...,,..,|||(({{{.||||,{{{..(((((..((......))..))))}..}}}.}}}},))))),,(((..(((.((((((((({({,..,}}.{{||||.........,{{|({|,..(((((((...((((((((.(.(((..((........))..))).,.,.))))))))......,((((((((.,,..((((((,(((.(((.(((((((((((((((((..((((.(({,,,{,{,,,,({.{,.{{{..,.}))}).}},,}}}},,.)}.))))...)))).......))))))))..))))).)))}}{((((((.......))))))}..,,...,..))))))...,,))))))))}).,)))))).,{{{{,{{{{{|{{{{(({{{,.,.,((((((((......})}}}}}}{{{{{{{|{.,,))))))))).,,,,,.......(((({.|.....}}.))))),{|........,,,...,,...}}}.,}})))).(((((((........)))))))..(((((((((((..(((.....))))))))))))))((((((...{{....(((....((((......))))....))).....,,...)))))).....,,,,...,,.,,,{{{{,{,....))))))).})))))))).)))..}))}})))}))))))},)))))))))))),,..})))))))).}}}.))},}.}|||||.||||{..,||}}|(((((((((((.((......}}..(((((.....))))).(((((....))))).,,.))))))))))}}..,,||||.,,.}}}}},....||..,})))))))))))})))})))))))}))...))}),,..})))))),)..})),..,,,,,,}}))))),))))))))))}}...},,....}}}.})))))))}}...........((((((((.......)))))))).....}})}),,||,|},,..........{(((((({...}}}}}}}}.,,,|{,{{..,{,{{((((....(((((.....)))))....))))}||||,}},,..,|,......}))),}},)))))))))}}..(((((((...,,.(((((((....))))))}..((((((.(.(((((((.....)))))))...,...))))))...,,,|{,...((((((....)))))),,,...{{{,..{{{{|||....,})))))}.,,,.)))))))...))))))....)))))))..))).)))))............((((((....))))))..)))))).........{((((.{(.(((((......)))))))...})))}.........{(((....}})},,,,,.....,,}|)}|..{{{{|{|.......,.,))))))))}.....,|||{|||}}..}}}||},}}}.,,)}}.,,)).))))...)).)))))))))).))))))))..,.))))))),,,(({{{{,,,,}}||||,.{{(((({,{((((..{{(((((.((,.((....)),,|}..})}}}.,}.,.))))),}.,||{|,{{.....,)),))))..,,,,,|((((((({(({{..,)}))))))},|||}}}..,,,..|||,...})))}}},...,,...,.{({{{,{,,....})))))))..,{(((.....)))))))).))))))).)))))).........(((((((.((...((((((((((.{((((((,,......,,.))))))|{{,...}||((((((((.......))))))))}|....{{{{,,....}}}}},...............{((((((......{(((.(((((............)))))))),(((((((.................)))))))......))))))})))))))))))).))))))).)))))).))))...))))).......(((((((((......))).))))))....

Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001321309.2 GGGCUCCCCGCGCCGCCCGGUCGGCAGCAGGGCGCUGAGCGAGCUCGGA… 9905 nt 0.4839
NM_005965.3 UUCAGGAACCGGGUUGGCGAAUGCAGUUGCCAGGUGUCACUGAUGCUAC… 5182 nt 0.4786
NM_053025.4 GGGCUCCCCGCGCCGCCCGGUCGGCAGCAGGGCGCUGAGCGAGCUCGGA… 10113 nt 0.4861
NM_053026.4 GGGCUCCCCGCGCCGCCCGGUCGGCAGCAGGGCGCUGAGCGAGCUCGGA… 9906 nt 0.4843
NM_053027.4 GGGCUCCCCGCGCCGCCCGGUCGGCAGCAGGGCGCUGAGCGAGCUCGGA… 9960 nt 0.4858
NM_053028.4 GGGCUCCCCGCGCCGCCCGGUCGGCAGCAGGGCGCUGAGCGAGCUCGGA… 9753 nt 0.4840
NM_053029.2 GGCGCUGAGCGAGCUCGGAGCCCGCGCUGUGCGCCUGCGGCCGGGGCGC… 7632 nt 0.5151
NM_053030.2 CUCAGGGAUUUGCUCUCCCCUGAAGUUUCUUUCUUACCCAGCCCCUUUU… 5195 nt 0.4774
NM_053031.4 AUUCCAUUCUCUGAACAUCUUCUGACACACUGACAGUGCUGAGCAGAGC… 4772 nt 0.3927
NM_053032.4 AUUCCAUUCUCUGAACAUCUUCUGACACACUGACAGUGCUGAGCAGAGC… 4775 nt 0.3927
Summary

This gene, a muscle member of the immunoglobulin gene superfamily, encodes myosin light chain kinase which is a calcium/calmodulin dependent enzyme. This kinase phosphorylates myosin regulatory light chains to facilitate myosin interaction with actin filaments to produce contractile activity. This gene encodes both smooth muscle and nonmuscle isoforms. In addition, using a separate promoter in an intron in the 3' region, it encodes telokin, a small protein identical in sequence to the C-terminus of myosin light chain kinase, that is independently expressed in smooth muscle and functions to stabilize unphosphorylated myosin filaments. A pseudogene is located on the p arm of chromosome 3. Four transcript variants that produce four isoforms of the calcium/calmodulin dependent enzyme have been identified as well as two transcripts that produce two isoforms of telokin. Additional variants have been identified but lack full length transcripts. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image