Basic Information
Symbol
APP
RNA Class
mRNA
Alias
amyloid beta precursor protein
alpha-sAPP
peptidase nexin-II
Alzheimer disease
amyloid beta (A4) precursor protein
AAA
ABETA
ABPP
AD1
APPI
CTFgamma
CVAP
PN-II
PN2
preA4
amyloid-beta precursor protein
alzheimer disease amyloid A4 protein homolog
alzheimer disease amyloid protein
amyloid beta A4 protein
amyloid precursor protein
beta-amyloid peptide
beta-amyloid peptide(1-40)
beta-amyloid peptide(1-42)
beta-amyloid precursor protein
cerebral vascular amyloid peptide
protease nexin-II
testicular tissue protein Li 2
A4
Amyloid-beta precursor protein
Alzheimer disease amyloid A4 protein homolog
Alzheimer disease amyloid protein
Amyloid precursor protein
Amyloid-beta (A4) precursor protein
Amyloid-beta A4 protein
Cerebral vascular amyloid peptide
PreA4
Protease nexin-II
Location (GRCh38)
21:25880535-26171128
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_000484.4
Sequence length
3583 nt
GC Content
0.4851
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1123.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1189.52 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1094.9
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_000484.4 | GUCAGUUUCCUCGGCAGCGGUAGGCGAGAGCACGCGGAGGAGCGUGCGC… | 3583 nt | 0.4851 |
| NM_001136016.3 | AAAUAGCACAGCCUUGCUGUGCGUGGUAGAAGUUGGGUUAGUGUUGACA… | 3572 nt | 0.4661 |
| NM_001136129.3 | GUCAGUUUCCUCGGCAGCGGUAGGCGAGAGCACGCGGAGGAGCGUGCGC… | 3190 nt | 0.4799 |
| NM_001136130.3 | GUCAGUUUCCUCGGCAGCGGUAGGCGAGAGCACGCGGAGGAGCGUGCGC… | 3415 nt | 0.4843 |
| NM_001136131.3 | GUCGGAUGAUUCAAGCUCACGGGGACGAGCAGGAGCGCUCUCGACUUUU… | 3295 nt | 0.4692 |
| NM_001204301.2 | GUCAGUUUCCUCGGCAGCGGUAGGCGAGAGCACGCGGAGGAGCGUGCGC… | 3529 nt | 0.4826 |
| NM_001204302.2 | GUCAGUUUCCUCGGCAGCGGUAGGCGAGAGCACGCGGAGGAGCGUGCGC… | 3472 nt | 0.4827 |
| NM_001204303.2 | GUCAGUUUCCUCGGCAGCGGUAGGCGAGAGCACGCGGAGGAGCGUGCGC… | 3304 nt | 0.4782 |
| NM_001385253.1 | GUCAGUUUCCUCGGCAGCGGUAGGCGAGAGCACGCGGAGGAGCGUGCGC… | 3415 nt | 0.4808 |
| NM_201413.3 | GUCAGUUUCCUCGGCAGCGGUAGGCGAGAGCACGCGGAGGAGCGUGCGC… | 3526 nt | 0.4853 |
Showing 1 to 10 of 11 entries
Summary
This gene encodes a cell surface receptor and transmembrane precursor protein that is cleaved by secretases to form a number of peptides. Some of these peptides are secreted and can bind to the acetyltransferase complex APBB1/TIP60 to promote transcriptional activation, while others form the protein basis of the amyloid plaques found in the brains of patients with Alzheimer disease. In addition, two of the peptides are antimicrobial peptides, having been shown to have bacteriocidal and antifungal activities. Mutations in this gene have been implicated in autosomal dominant Alzheimer disease and cerebroarterial amyloidosis (cerebral amyloid angiopathy). Multiple transcript variants encoding several different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2014]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
