Basic Information

Symbol
MYO1E
RNA Class
mRNA
Alias
myosin IE MYO1C HuncM-IC MGC104638 myosin-IC FSGS6 unconventional myosin-Ie MYO1E variant protein unconventional myosin 1E Unconventional myosin-Ie Myosin-Ic Unconventional myosin 1E
Location (GRCh38)
15:59132434-59372871 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_004998.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_004998.4
Sequence length
8644 nt
GC Content
0.4759

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2683.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2846.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2640.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_004998.4 GAGACUCAGCCAGAGGAGUACGGAUUAAGUGGCCGAAGAAAGAGGAGUG… 8644 nt 0.4759
Summary

This gene encodes a member of the nonmuscle class I myosins which are a subgroup of the unconventional myosin protein family. The unconventional myosin proteins function as actin-based molecular motors. Class I myosins are characterized by a head (motor) domain, a regulatory domain and a either a short or long tail domain. Among the class I myosins, this protein is distinguished by a long tail domain that is involved in crosslinking actin filaments. This protein localizes to the cytoplasm and may be involved in intracellular movement and membrane trafficking. Mutations in this gene are the cause of focal segmental glomerulosclerosis-6. This gene has been referred to as myosin IC in the literature but is distinct from the myosin IC gene located on chromosome 17. [provided by RefSeq, Jan 2012]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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