Basic Information
Symbol
MYOM1
RNA Class
mRNA
Alias
myomesin 1
skelemin
myomesin 1 (skelemin) (185kD)
myomesin 1 (skelemin) 185kDa
myomesin 1, 185kDa
myomesin-1
190 kDa connectin-associated protein
190 kDa titin-associated protein
EH-myomesin
myomesin (M-protein) 1 (190kD)
myomesin family member 1
Myomesin-1
Myomesin family member 1
Location (GRCh38)
18:3066693-3220126
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_003803.4
Sequence length
5707 nt
GC Content
0.4934
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1854.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1956 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1669.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_003803.4 | GACUGCCUGACCACAUGCAUUAUUUUUGAACUGGCCCCCAGGGUCCUGU… | 5707 nt | 0.4934 |
| NM_019856.2 | GACUGCCUGACCACAUGCAUUAUUUUUGAACUGGCCCCCAGGGUCCUGU… | 5419 nt | 0.4909 |
Summary
The giant protein titin, together with its associated proteins, interconnects the major structure of sarcomeres, the M bands and Z discs. The C-terminal end of the titin string extends into the M line, where it binds tightly to M-band constituents of apparent molecular masses of 190 kD (myomesin 1) and 165 kD (myomesin 2). This protein, myomesin 1, like myomesin 2, titin, and other myofibrillar proteins contains structural modules with strong homology to either fibronectin type III (motif I) or immunoglobulin C2 (motif II) domains. Myomesin 1 and myomesin 2 each have a unique N-terminal region followed by 12 modules of motif I or motif II, in the arrangement II-II-I-I-I-I-I-II-II-II-II-II. The two proteins share 50% sequence identity in this repeat-containing region. The head structure formed by these 2 proteins on one end of the titin string extends into the center of the M band. The integrating structure of the sarcomere arises from muscle-specific members of the superfamily of immunoglobulin-like proteins. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
