Basic Information

Symbol
NBAS
RNA Class
mRNA
Alias
NBAS subunit of NRZ tethering complex NAG neuroblastoma amplified sequence ILFS2 SOPH NAG/BC035112 fusion NAG/FAM49A fusion neuroblastoma-amplified gene protein Neuroblastoma-amplified gene protein Neuroblastoma-amplified sequence EC 1.1.1.94 EC 1.2.1.59
Location (GRCh38)
2:15166913-15561340 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_015909.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_015909.4
Sequence length
7278 nt
GC Content
0.4604

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2261.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2398.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2331.57
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((..(((((((((.(((......(.((((((........)))))).).....))).))).))).)))..)))..))))))).((.((((...(((((....)))))..((((((((((((((((((...((((....(((((((((..((((......))))....))))))..(((.((((.....)))).)))................((((.......)))).......)))..))))....)))).....))..))).))))))))).......(((((..(((((((((((.(.......(((((((((.((((((((((.....(((..(((.((((.((((((((((..(((.....)))))))))).))).)))))))..)))..))))).(((((....(((((...((.....))...)))))....)))))....((((.((((((((...(((.(((.....))).)))....)).))))))...))))....(((((((((........))))))))).((((((((......)))))).)).))))).).))))))))......((((((...))))))..).))))))).)))).))))).....((((((((........))).))))).(((((.(((....))).)))))((((((((.....(((((.............(((((((.(((((...((((((((.((...((((..((.((((((((...........(((((((((.(((((.(((((((((((.(.(((((..(((....((((((.((((..((((...)))).)))).....))))))...)))..))))).).))))))....))))).((((((((...((((((((((((((.((....)))))(((((..((((((((......((((....(((....(((((.(((((..((((((...(((((((.(((((....(((((((......((((((((((((.((((...)))).))........(((((.....))))))))))))).)).(((((..((((((((.(((.((((.((((((((..((.(((......)))))..)))))))).))))..)))((((((((((.......))))).....(((((..((...(((((((((((..((((((((........))))))))(((.....))).....((((..(((.(.((((((((.((((((...(((((....)))))...))))))..........((((((((.((((.((((....))))))))....(((....))).((((...))))))))))))..((((((.(.(((((......)))))).))))))...(((.....)))))))))))).)))..)))).........)))))))))))...))))))).....((((..(((((((.......))))))).))))......((((.((..(.(((((....((((......))))....))))).)..)).)))).......................)))))((...(((((((((((((.......(((((((((.((......................((((((((.((...(((((..((((.........)))).)))))))..))))))))..((((.((.((((((((..((((.((((......(((((.(((((((....)))))))........))))))))))))).))))))))..)).)))))).))))))))).....)))))).)).)))))...)))))))))).)))))......((((.(((.(((((((((.............((((((((....(((.((((((.(((.(((((..(((((((..((...((.(.((......)).).))...)))))))))..))))).)))..))))))..........(((((((...(((.....)))........(((((....)))))..)))))))..........((((((....((((((.((.....((((((((((........................((((.....(((((...((....))...)))))))))...((((((.....((((.(((((((((...)).)))))))..)))).....))))))....((((........))))((((...(((...)))....))))....))))))))))....)).)))))).(((((((...(((((..((((....((((..........)))).....(((((((.(((((....((((....((((((.((((...((((....(((((((..(((((..((((((((((.............((((((........))))))))))))))((((.((((...((((((((........((((((................(((((.((((..((.((((((((.....)))))))).))...)))).))))))))))).((((((((((((.((((((....(((((((((...((((((........((.((((((.(((((((((((((((.((((...((((((((.....(((....)))(.(((((((((...(((..........((((((((.....((.(((((((...)))))))))..)).))))))...........)))...))))))))).)............(((((..............)))))))))))))....)))).))))).)))))..((((.....)))).....(((((((....)).)))))))))))))))).))((((((..(((.(((((((......))))))).))))))))).((((((.........))))))..(((((((((((((...((...((((((((((((((.......(((((.(((((......))))).).....((((....))))..........((((((.((((((....(((((((((.((((((.(((.((....((.....))...))))).))))))...)))))))))....(((.(((((((..((((((((....)).(((((((....))).)))))))))))))))))))).......(((..........)))...))))))))).....)))((((((((((.((.....(((......)))..)))))))))))).(((((.(((((((.(((.......))).))))))).)))))...))))....))))))).((((((((....((((((......)))))).))))))))))).)))).))..)))..))))))))))((((((....))))))))))))....)))..........((((((((((((....(.(((((((((((((.(((................((((((..((((......(((....)))...((.(((((((.(((.......)))))))))).))...)))))))))).((((((......))))))....)))...))))).))).))))).).))))))))))))))))))....)))))).))).(((.....)))(((((.(((((((..((((.(((.(((..((((.(((((((.(((.((.((.((((((((((.......))))))..(((.(((((..((......))..))))).)))...(((.((.......)).))))))).)).)).))))).))))).)...((((((((.....((.(.((((........)))).).))..))))))))...)))..))).))).)))).))))))))))))....(((.....))))))))))))....))))))))...))))..))))....((((((((.((((..((((((((...)))))))).)))).)))).))))))..)))))..)))))))((((...(((.....((((.((((...........)))))))).....))).)))).........))))..)))).))))))..((((....)))).....(((((((.............)))))))))))....)))))..)))))))........(.(((((.((.........)).))))).).))))..))))))))))))))))))(((((((.((((((...........))))))....)))))))..))).....))))))))..((((((..(((.(((....(((((.......)))))..))).)))...))))))((((((((.....))))..))))..((((....))))......((((((((.(((.........((........))...((((.....((((..((((((((((((........(((...((((((......((((((.(.(.....).).))))))....))))))....))).....(((((((....(((..(((....)))..)))....)))))))..((((((.(((((.........(((((....)))))............((.(((((.....))))).))))))))))))))))))))..)))))..))))......)))).))).))))))))((((....(((((..(((((.....((.((((((.......)))).)).))......))))).)))))..))))..))))))))).))).)))).(((((((((.(((((((((((((.((((..(((((((((...(((.....))))))))...........((((((((((((.((((.(((.....)))))))..))))))..((((........)))).))))))((((((...))))))................))))..))))..(((((((.(((((((.((((((((((((((((...((.(((((((((((.((((....(((((........((((.....)))))))))..)))))))))..(((((((((((..........)))).)))))))(((((.........)))))......((((..((....))..)))).((((.((((...((((.((((((....))))))...........))))....))))))))...(((((((((...))))...)))))..(((((..((((((....((((....(((((...(((....)))...))))))))))))))))))))......)))))))).......)))))))))))).......)))).)).......))))).)))))))....((((..((((.....((((.....))))...))))..))))(((.((((..(((................))).))))..)))....)))))..)))))))).)).)))))))..............))))))).....)))))..)))))))......))))))((..(((((((((((.((((.....))))..)))))...))))))..)).(((((....)))))))))))))))...)))..)))).....))))))))..)))))..(((((((.((((((((...........))))))))))))))).)))))))))))..))))))))....((((((.....))))))............))))))))))))))))))))..)).))...))))...))))))))))...)))))....)))))))......((((.(((......))).))))...((((.((((..(..((((.....))))..)..))))..))))......((((((((.((((.(((((((((.((((.......((....))........(((((((((((((((.(((((((..(((...((((((((......))))..........)))).))).(((((......))))).....)))))))......))))))))))))))))))).)))))))))))))..(((((((.((......))..)))))))(((.((((.((((((((...((((((((((.....((.((((((((((..................)))))))))).)))))))((((((((....((.((.((..((((....(((((((((.((((((((((((((((((((((.((((.((((((.(..(..((((((((......))))))))..)..).)))))).))))))))..........))).))))))))))((((((((.(.((((...((((((.((..((((.....(((((..((((((((((((((((((((.........))))))..((((....))))....(((..((((...(((....)))....))))..)))(((((((((.......................)))).)))))((((..((....))..))))..)))))...(((((((((...))))).))))...........(((.(((((((((((((((............................))))))))....((((.........)))).((...(((.(......).))).)).((((.(((((((.((((((((......(((((((((.(((........)))(((((((((....((((((((..(((((.(((.((....)).))).)))...))..)))).))))...((((((.(....(((((...)))))).)))))))))))))))..))).))))))(((.((((.......((.((((....)))).)).......))))..))))))))))).))))))).))))....)))))))))).))))))))))))))(((((((((..(((((.......((((.(((.....))).))))...((((......))))))))).)).)))).)))((((....))))(((((((((((..((....))..))).))))))))..)))))))))))))))).).)))).))))))))).)))))))))....))))..)).)).))))))))))))))))))))))).)))).)))(((((....))))).....((.((((((((.....)))....))))).)).......)))))))).....))))).....))))))))....((((........)))).)))).)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((((((..(((((((((.(((...,,.(.((((((........)))))).)..,,.))).))).))).)))..))),.))))))).((.((((...(((((....))))}..{((((((((((((((({(.{,((({....{{{{{({((,.((((......}))),...}}}}}}..(((.((({.....)))).))).||............,|{{{.......}))}...|||,})}..,,}},,.})}}|..,..))..}))||)))))))}.......(((((..{((((((((((,(,{,{,{.((((((((,.(((((,,{{{,{(({,,...,,,}}}}{{(({((((((,.{(((.....))))))))))}))}{({....)}}|,...}}}}|,|{{{{....(((((...{{{,...)).,.))))),,..}}}}},,.,(({{{(((((({{,{,(((.(((.....))).)))..}.))}}))))}...))))....(((((((({.{.....}))))))))).{{((((((......)))))).)}.})))).}.)))))))),,},.,((((((...})))))..},))))))).)))).))))).....((((((((........))).))))).(((((.(((....))).))))|((((((((....,,{,(({.,{{{,{{{{(.(((((((.(((((...((((((((.((...{{((..((.{(((((((...........(((((((((.((({......{(((.(((.(((.((((((...,,{((({,.{{((..((((...)))).)))),}.}}}}|((((((.....))))))}((((((({,......{.((((((((...(((((((((({(({,((....)))))(((((..((((((((.{{{,{((((....({{{{..{{{{,.(((((..((((((...(((((((.(((((....((((((({{{{{.(((((((((((((({(,,,,|||,{||,,{,...,(((((.....)))))|},,}}}}.{{{{{{{{{{((,..,,..,,,,|||{.|||||||{..|||{{{..,,,,)}},}..}}}||}}}.||}}..||}||,}|{((({...,})}})}),.....,|||,..||,.{(((((((,{{{.(((((((((.,....,.))))))))).,,,....((((((((((.{((.....}}|,,((({((((((..,(((((....})))).,.)))))).,,{{{{.((({...}))}|||}||(((....)))}})))}..})))))))))..((({...}))))}}}}}}}..((((((.(.(((((......)))))},)))))),}}}})))))))))),,}}||||,|,|,,||,((((,.{{.,{{({(((({{|{,,||,|,||..|,,,,,{,,(((((((,......}||||||.||,,...,{{(({{.,,..,|(((({|,,|,,.{{{.||(|{{(,(,,{{{{{,|.,}},||||,....,{{|||||,,........}}}||||{{{({{{{{{|{{{{|...,,.,{|{{{((((.{{.,.....,,,,.,.,||,,{(,((((({,..,(((.,,,,,,,|||||}}}}|},{{(((({|{|((((.((((......,.}))))))}{{{,(((,{(((,(,,,..,}}}|||||.(((((((....)))))))........}}}|||}}|||||,|}}||||,{,({({{|({{,|||{((((({{..,{(({|{{((((,,,,....,|||||}|||||({|.,,..,(({{.{({,((({{{((({{{{{,,{...,|{{||||||||,{{{{.((((((.(((.(((((..(((((((,.,,...{,.,.{{......},.},,},.,}))))))))..))))).)))..))))))..........(((((((,.{(({....,|||.,......{{{{{....})))}..}}}}}}},{{{{.,..{{(({{{....((((((,{,,,({,{{{||||||||||..........,,,,.|,},||{{{,...,{(((((...((....))...)))))))}},,,((((((.....((((.(((((((((...})})))))))..))))...,.}))))).,,.{({(........}}}|{(((...(({...|,|....|}}||...|||||}}}}}....||,||}}||.{((((({{{|{{{{{,{((((,..,(((({{......{{((,,(({{.,{(({{{{(..,,....,|{({{{.{{((((.{{{{..,{{,,...,(({{{,,.,|||{{|,{|||||,|||}}},}},},....((((((........)))))),..(((((((((((((({...,,}}}|,}))))}}.,}})),.,,.,.,,,....,})}|(((.((((..({.((((({,,.....,})))))).))...)))).)))})))))))}||||.|||}{((,{{{{{{,.,,|{(((((((...{{(((({....}|}|(.((((({{{((((((((((((((.((((...(((((((({,,,.{{{.,.,))){.(((((((((.,,(((,,,,,.....{|||||,,.,...{({{((((({...})))))||}}}||.}}}}}},..,.......)))...))))))))).}............,{{{{...,,...,.,,..}))))})))))))....)))).)))))}}})))..,{{({.{{,}}}},,,,,{(({{(({...,)}))))}))))))))))).)}((((((,.{((.(((((({......})))))).))))))))).((((((.........))))))..(((((((((((((...{{...((((((((((((((.....{.((((,.(((((......))))),|.,,,,((((..,,}}}},,........,{{{.{,...,|.,,..((((((((({((((((.(((.((....{{.....}}...))))).))))))},.}))))))))....(((.(((((((,.((((((((....)).(((((({....})).))))))))))))))))))))......,||,,|,,,,{{..,,..,})).,,||||....,},.((((((((((.((.....(((......)))..)))))))))))).(((((.(((((((.(((.......))).))))))).)))))...}))}....))))))),((((((((....((((((......)))))).)))))))),)),}))).))..))),.,)))))))))((((({....)))))))))))},|.,))}.,........((((((((((((....{.(((((((((((((.{{(,,.{({,....,{{,.((((((..{(((......(((....)))...{{.{((((((.(((.......)))))))))),})..,)))))))))).|{|||{......})))))}}..}))...))))).))).))))).}.))))))))))))))))))....))))),.})),}}}|||,{|||{{,(({(((((((..,{{,,||(,((({,,,,.}|||||||}|||}|{..,.{|||||,,{{....,.,}})))),,|{|,{{{((..((......))..))))).))),..(({,{{.....,,}},}}}||}}.,,,}}.,,,,,.,}}}},,...((((((((.,,{,((.{,((((....,,..)))),).))..))))))))...))},,))},})).}))}.}))))))}||||||}}}},.}}}}}||}}}}}|}}}...,}|||},}},,,)})}},}))))}}}||{{((((.((((,.{((((((,...}))))))),)))).)))),}}}|||,,|||}}..||}}}}}{{{{{||(((.....||||||{{{{.,.|||,,,,}}},))},...,|}||.|||||||,||...||,,.,}}}}.}))})),,{{{|...,)))).,,,,|||(((({{{....,,))}}||}||||{.,.{{{..,.,...)))}})}}},.,.||{.(((((,((,.....,,.||.,}))),).}})).})}))))))))))}}}}},(((((((.((((((.,......,,,))))))....))))))),,|,|,,..,}})))))},,||||{{..{((.(((....{{|||,.,.,,,))))).,))),)))...}}|||}((((((((.....)))}..)))).,||{{....))))).....||||||||}|||.,||...||(({.{{.{{,|,..,|{{|.|,,.{{({..{((((((({{{({{{{{{,{{{|.,||{{{{||||,.,,,|||}||.,}},}}}}},})}}))}...,))})}}|..,,|,|{|,{((((((....(((..(((....)))..)))....))))))}..(((((({(((((.........(((((....)))))...........,((.(((((.....))))).))))))))))))).,,}}}|,.,}}}|,|}}}},,,...}}}},}}),,,.,,,},,|,||||{||||},,||||||,,..,..,|||{{,...,,,))}),}}.}),,,,,.}||||.}||,|,,....,,})))))))).}||.||}|.{{{{{{||{||||||||||||||..,,,,|,|||{{{{,..,|||}|..,)}},,})}.,.......,.{(((((((((((.((((.(((,...,)))))))..))))))..(((({......,)))}.}))))}((((((...))))))....,|||,|{||,.}))),,,})}}}}|||||{{,|||||||}||||{{{{|,,||(((|||{{||{{|{{(((((.((((....(((({.......|{({|.....)))))))))..))))))))}{((((((((((((..........)))).))))))))}{{{........,}||}|{{{|,.||{{,.{{,,..}},.}}}}.},)))||||}},|}|,.{{{{{|,.,.,))))),},}}......,,,.....),}}}},,,.,{{(({{{((...}))}...))))).,(((((..((((((...,((((,...{((((...(((....)))...)))))))))))))))))))}.,.,,})))|||||.,,.|||}}}}}}}})))}....}}}))}},}}},|,,,||||}}.|||}|}}.....,||}},,.|,,...,{{{,||,||}||,,,})}},.})}||||.((((..(((................))).))))..,,)},}})))})))),},}))}}}}.,)))))))},,.,}}}}....,)))))).....)))))..)))))))......)))))){{..(((((((((((.((((.....))))..)))))...))))))..}}.(((((....))))))))))})}))...))))}}.))}}...))))))))..)))))..((((((,{((((((((.......,...))))))))))))))).,))))))))))..))))))))}.....|})))).)}))))))).))).))).)))))))))))))))))))))}.})).}}..,)))}...)}))))))))...}))))....)))))))...,}.}}}}.}}}.}.,}}}.,,|......{(((.((((..(..((((.....))))..)..))))..}))}.,,,..||{|,,,|}}||,.,((((((({,..(({{{{.{{,,....||....,,..(((((((((((((((.(((((((..{{,...((((((((......))))..........)))}.}}}.{((((......))))).....))))))}......)))))))))))))))...{{||.{({.(((((((((((((((.((......))..))))))))))......))))).))).}))}(((((((((.((((.((((((((((..................)))))))))}.,|((((((,,,(((((((((((((((((...)).)))))),}})))){{((.((((((((((((,((((.((((.((((({.(,.(..((((((({......})))))))..)..),}))))).)))))))).,|,.....,|}}.)))))))))){{||||{{|||||,{||.,,,,||,|||}||{{...{|||||,.,{{,{{{,||,{{{{((((((.........))))))}.|||{....)))}}}}.|{{,.((((...(((....)))....}}}},,|||(({{{{{{(,,.,.{{...,,,,.,},...,.)))).)))))|{((..((....)),,))}}.,,}|}|||||{{((((((...))))).)}))||,,,|||,,,,{,}||.,,|}}}}}{{{{,...||||.....}}}},..,....}))).))))))))}.,,||...}}}}}),}},.)))))))..,.{{{{{{{{{{{|{.{(((.,((((((.((((((((......(((((((((.,{({..........(((((((((....((((((((..({(((.(((.((....)).))).)))...))..))))},)))...((((((.(....(((((...)))))}.)))))))))))))))..))).))))))(((.((({.......((.((((....)))).)).......})))..))))))))))).))))))|,|||}{{{{|||,.|||||{||,||||||{{{||{|{{{{{{{.,,,{{{,{,,..,{{{{.{{{,,.,,})),,,||.,{||||,,..,.))))))}}),}),)))).)))|,||}}}}||||((((((({({{..(({{{.||{,|||,|||,||||{{{{,,,,,,,))))))),,,}))).))))))),).,.)))))},.,.}})})}}|)}|||{{||,|.}}}}}))})|||||||.,,,)))))|||||,.,,))))).....||}||||||}}.|.,|}}},}}}}||||.}},.....,))})))})}..}))))))))}}.)))))))),..,||||........)))},)))).)}.

Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_015909.4 ACUCCUCCGCUGCCUGAGUCCUCGGCGAACAUGGCGGCCCCCGAGUCAG… 7278 nt 0.4604
Summary

This gene encodes a protein with two leucine zipper domains, a ribosomal protein S14 signature domain and a Sec39 like domain. The protein is thought to be involved in Golgi-to-ER transport. Mutations in this gene are associated with short stature, optic nerve atrophy, and Pelger-Huet anomaly. [provided by RefSeq, Oct 2012]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image