Basic Information
Symbol
NCF2
RNA Class
mRNA
Alias
neutrophil cytosolic factor 2
p67phox
NOXA2
NADPH oxidase activator 2
chronic granulomatous disease, autosomal 2
neutrophil cytosolic factor 2 (65kD, chronic granulomatous disease, autosomal 2)
NCF-2
P67-PHOX
neutrophil cytosol factor 2
67 kDa neutrophil oxidase factor
neutrophil NADPH oxidase factor 2
P67PHOX
Neutrophil cytosol factor 2
Neutrophil NADPH oxidase factor 2
p67-phox
Location (GRCh38)
1:183554461-183593499
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_000433.4
Sequence length
2267 nt
GC Content
0.4914
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-738.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-784.35 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
601.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_000433.4 | AUUCUACUCAUCUGGCCCAGAAAGUGAACACCUUGGGGGCCACUAAGGC… | 2267 nt | 0.4914 |
| NM_001127651.3 | CUCACUCUAGGUCACGGGUUUCAUUUGGGACCAGUAGCCUAGUCUUUCA… | 2242 nt | 0.4880 |
| NM_001190789.2 | AUUCUACUCAUCUGGCCCAGAAAGUGAACACCUUGGGGGCCACUAAGGC… | 2024 nt | 0.4926 |
| NM_001190794.2 | AUUCUACUCAUCUGGCCCAGAAAGUGAACACCUUGGGGGCCACUAAGGC… | 2132 nt | 0.4944 |
| NM_001410895.1 | CUCACUCUAGGUCACGGGUUUCAUUUGGGACCAGUAGCCUAGUCUUUCA… | 2134 nt | 0.4859 |
Summary
This gene encodes neutrophil cytosolic factor 2, the 67-kilodalton cytosolic subunit of the multi-protein NADPH oxidase complex found in neutrophils. This oxidase produces a burst of superoxide which is delivered to the lumen of the neutrophil phagosome. Mutations in this gene, as well as in other NADPH oxidase subunits, can result in chronic granulomatous disease, a disease that causes recurrent infections by catalase-positive organisms. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jun 2010]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
