Basic Information
Symbol
NELL2
RNA Class
mRNA
Alias
neural EGFL like 2
NRP2
nel (chicken)-like 2
NEL-like 2 (chicken)
protein kinase C-binding protein NELL2
NEL-like protein 2
NEL-related protein 2
neural epidermal growth factor-like 2
Protein kinase C-binding protein NELL2
Nel-related protein 2
Location (GRCh38)
12:44508274-44921889
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001145108.2
Sequence length
3553 nt
GC Content
0.4571
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1091.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1161.01 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1031.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001145107.2 | AGGCUCGCCAUCCGUCCCCACCAGUCUCUACCUACUUUGCCCAGCUCCA… | 3407 nt | 0.4547 |
| NM_001145108.2 | AUUGUCUCUGCCUUUACAACAGGUUCGGGCGGCGGGGAAGACGGGGGGG… | 3553 nt | 0.4571 |
| NM_001145109.2 | AGUCCAGGGUCGGAGGGCUGAGGGGGAACUUUGCAGAGAGAAGGGUUUA… | 3162 nt | 0.4402 |
| NM_001145110.2 | ACUGAGCAAUUGGAUGUGGGAUGUGAGAGAAAUGACUCCAAGGUUUUUG… | 3329 nt | 0.4323 |
| NM_006159.2 | UUUGGCAUCCAGGAGACCGUGCGGGAGACCGACGCUGAGCGCCGGCCUC… | 3312 nt | 0.4529 |
Summary
The protein encoded by this gene is a glycoprotein containing several von Willebrand factor C domains and epidermal growth factor (EGF)-like domains. The encoded protein acts as a homotrimer and is found in the cytoplasm. Several variants encoding a few different isoforms exist, and at least one isoform appears to be a secreted protein. Studies in mouse suggest that this protein plays a role in neural cell growth and differentiation as well as in oncogenesis. [provided by RefSeq, Feb 2009]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
