Basic Information

Symbol
NEUROD6
RNA Class
mRNA
Alias
neuronal differentiation 6 Atoh2 NEX1M Math-2 bHLHa2 Nex1 neurogenic differentiation 6 MATH2 neurogenic differentiation factor 6 brain my051 protein class A basic helix-loop-helix protein 2 protein atonal homolog 2 ATOH2 BHLHA2 Neurogenic differentiation factor 6 NeuroD6 Class A basic helix-loop-helix protein 2 Protein atonal homolog 2
Location (GRCh38)
7:31337465-31340726 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_022728.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_022728.4
Sequence length
1959 nt
GC Content
0.3925

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-460.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -500.92 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 416.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_022728.4 ACUUUUUAGAGAUCAAUGAGAUAGUGCAGAUAUACACAGAUCUAGAGAC… 1959 nt 0.3925
Summary

This gene is a member of the NEUROD family of basic helix-loop-helix transcription factors. The encoded protein may be involved in the development and differentiation of the nervous system. [provided by RefSeq, Nov 2012]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image