Basic Information

Symbol
AQP1
RNA Class
mRNA
Alias
aquaporin 1 (Colton blood group) CHIP28 Colton blood group aquaporin 1 (channel-forming integral protein, 28kDa) aquaporin 1 (channel-forming integral protein, 28kDa, CO blood group) aquaporin 1 AQP-CHIP CO aquaporin-1 Colton blood group antigen aquaporin 1, Colton blood group antigen aquaporin-CHIP bloodgroup CO protein channel-like integral membrane protein, 28-kDa urine water channel water channel protein for red blood cells and kidney proximal tubule Aquaporin-1 AQP-1 Aquaporin-CHIP Urine water channel Water channel protein for red blood cells and kidney proximal tubule
Location (GRCh38)
7:30911720-30925517 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_000385.3
BLAST PRIMER
NM_001185060.1
BLAST PRIMER
NM_001185061.1
BLAST PRIMER
NM_001185062.1
BLAST PRIMER
NM_001329872.2
BLAST PRIMER
NM_198098.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_198098.4
Sequence length
2754 nt
GC Content
0.5588

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1089.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1136.47 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 660.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_000385.3 AGCUCUCAGAGGGAAUUGAGCACCCGGCAGCGGUCUCAGGCCAAGCCCC… 1682 nt 0.5862
NM_001185060.1 UAAAAGUGGCCCAGGAGAGUGCUCCUGACCAUCACCUUCAUGCCUGGGG… 2487 nt 0.5505
NM_001185061.1 GAGAGGGUGGAGACAAUAGGGAGGCAGGCACAGAGGAGAAAGAGGGGUG… 2662 nt 0.5526
NM_001185062.1 AAUAGGGAGGCAGGCACAGAGGAGAAAGAGGGGUGGAGGGAGCCAGGAC… 2434 nt 0.5468
NM_001329872.2 AGCUCUCAGAGGGAAUUGAGCACCCGGCAGCGGUCUCAGGCCAAGCCCC… 2536 nt 0.5580
NM_198098.4 AGCUCUCAGAGGGAAUUGAGCACCCGGCAGCGGUCUCAGGCCAAGCCCC… 2754 nt 0.5588
Summary

This gene encodes a small integral membrane protein with six bilayer spanning domains that functions as a water channel protein. This protein permits passive transport of water along an osmotic gradient. This gene is a possible candidate for disorders involving imbalance in ocular fluid movement. [provided by RefSeq, Aug 2016]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image