Basic Information
Symbol
NIPSNAP3B
RNA Class
mRNA
Alias
nipsnap homolog 3B
FLJ11275
NIPSNAP3
SNAP1
nipsnap homolog 3B (C. elegans)
FP944
protein NipSnap homolog 3B
Protein NipSnap homolog 3B
NipSnap3B
Location (GRCh38)
9:104763850-104777764
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_018376.4
Sequence length
5547 nt
GC Content
0.3898
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1353.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1464.44 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1697.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_018376.4 | CCUGCCUGAGUUCGCCAGUGGUCCAGGAGCCGCUUUUUUCCACUCGGGA… | 5547 nt | 0.3898 |
Summary
NIPSNAP3B belongs to a family of proteins with putative roles in vesicular trafficking (Buechler et al., 2004 [PubMed 15177564]).[supplied by OMIM, Mar 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
