Basic Information

Symbol
NIPSNAP3B
RNA Class
mRNA
Alias
nipsnap homolog 3B FLJ11275 NIPSNAP3 SNAP1 nipsnap homolog 3B (C. elegans) FP944 protein NipSnap homolog 3B Protein NipSnap homolog 3B NipSnap3B
Location (GRCh38)
9:104763850-104777764 UCSC Genome Browser

Secondary Structure

MANE Select
NM_018376.4
Sequence length
5547 nt
GC Content
0.3898

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1353.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1464.44 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1697.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_018376.4 CCUGCCUGAGUUCGCCAGUGGUCCAGGAGCCGCUUUUUUCCACUCGGGA… 5547 nt 0.3898
Summary

NIPSNAP3B belongs to a family of proteins with putative roles in vesicular trafficking (Buechler et al., 2004 [PubMed 15177564]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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