Basic Information

Symbol
NOXO1
RNA Class
mRNA
Alias
NADPH oxidase organizer 1 P41NOXA P41NOXB P41NOXC SH3PXD5 SNX28 P41NOX NADPH oxidase regulatory protein Nox organizer 1 SH3 and PX domain-containing protein 5 nox-organizing protein 1 regulatory protein P41NOX Nox-organizing protein 1
Location (GRCh38)
16:1978912-1984636 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001267721.2
BLAST PRIMER
NM_144603.4
BLAST PRIMER
NM_172167.3
BLAST PRIMER
NM_172168.3
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_172167.3
Sequence length
1541 nt
GC Content
0.6768

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-752.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -778.6 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 370.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001267721.2 AGUCUUGCACGCCUCCAGGGCUGGAAAGCUCAUUCUUCUUCUUCCUCCC… 1553 nt 0.6780
NM_144603.4 AGUCUUGCACGCCUCCAGGGCUGGAAAGCUCAUUCUUCUUCUUCCUCCC… 1538 nt 0.6775
NM_172167.3 AGUCUUGCACGCCUCCAGGGCUGGAAAGCUCAUUCUUCUUCUUCCUCCC… 1541 nt 0.6768
NM_172168.3 AGUCUUGCACGCCUCCAGGGCUGGAAAGCUCAUUCUUCUUCUUCCUCCC… 1556 nt 0.6774
Summary

This gene encodes an NADPH oxidase (NOX) organizer, which positively regulates NOX1 and NOX3. The protein contains a PX domain and two SH3 domains. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2012]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image