Basic Information
Symbol
AQP9
RNA Class
mRNA
Alias
aquaporin 9
SSC1
HsT17287
AQP-9
T17287
aquaporin-9
aquaglyceroporin-9
small solute channel 1
Aquaporin-9
Aquaglyceroporin-9
Small solute channel 1
Location (GRCh38)
15:58138169-58185914
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_020980.5
Sequence length
2849 nt
GC Content
0.4356
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-801.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-857.52 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
758.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001320635.2 | CCACCAGAAGACGAUUAAGCCACAGCCUCUAAUUGGAACGGCAUUUGUA… | 2631 nt | 0.4265 |
| NM_001320636.1 | AAAAUCUUUUCUGGACCAGGGCCCGUCACUGUGAUUUGGCAACACAACU… | 2666 nt | 0.4295 |
| NM_020980.5 | CCACCAGAAGACGAUUAAGCCACAGCCUCUAAUUGGAACGGCAUUUGUA… | 2849 nt | 0.4356 |
Summary
The aquaporins are a family of water-selective membrane channels. This gene encodes a member of a subset of aquaporins called the aquaglyceroporins. This protein allows passage of a broad range of noncharged solutes and also stimulates urea transport and osmotic water permeability. This protein may also facilitate the uptake of glycerol in hepatic tissue . The encoded protein may also play a role in specialized leukocyte functions such as immunological response and bactericidal activity. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2016]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
