Basic Information
Symbol
NR3C1
RNA Class
mRNA
Alias
nuclear receptor subfamily 3 group C member 1
GR
glucocorticoid receptor
nuclear receptor subfamily 3, group C, member 1
nuclear receptor subfamily 3, group C, member 1 (glucocorticoid receptor)
GCCR
GCR
GCRST
GRL
nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 variant hGR-B(54)
nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 variant hGR-B(77)
nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 variant hGR-B(93)
Glucocorticoid receptor
Nuclear receptor subfamily 3 group C member 1
Location (GRCh38)
5:143277931-143435512
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_000176.3
Sequence length
6778 nt
GC Content
0.4035
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1880.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-2013.53 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1769.57
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
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Summary
This gene encodes glucocorticoid receptor, which can function both as a transcription factor that binds to glucocorticoid response elements in the promoters of glucocorticoid responsive genes to activate their transcription, and as a regulator of other transcription factors. This receptor is typically found in the cytoplasm, but upon ligand binding, is transported into the nucleus. It is involved in inflammatory responses, cellular proliferation, and differentiation in target tissues. Mutations in this gene are associated with generalized glucocorticoid resistance. Alternative splicing of this gene results in transcript variants encoding either the same or different isoforms. Additional isoforms resulting from the use of alternate in-frame translation initiation sites have also been described, and shown to be functional, displaying diverse cytoplasm-to-nucleus trafficking patterns and distinct transcriptional activities (PMID:15866175). [provided by RefSeq, Feb 2011]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
