Basic Information

Symbol
NRCAM
RNA Class
mRNA
Alias
neuronal cell adhesion molecule KIAA0343 Bravo NgCAM-related cell adhesion molecule NEDNMS neuronal surface protein Bravo Neuronal cell adhesion molecule Nr-CAM Neuronal surface protein Bravo hBravo Ng-CAM-related
Location (GRCh38)
7:108147623-108456717 UCSC Genome Browser
Transcripts

Secondary Structure

MANE Select
NM_001037132.4
Sequence length
6701 nt
GC Content
0.4214

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1859.39 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1991.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1820.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.(((((((((((.....)))))))).)))(.((((.(((((.((.......)).))))))))).).....(((..(((((((((.(((((.(((((..((((((((((((((((((((...((((((...(((((((((...((((((((((((((((((.(.(((........))).)))))))(((.....))).((((((((..((.((..((((((....(((.((((.(((((((((((((..((......((((((((((...(((((((((((((((.(((....(((((......((((......))))(((((.(((((......))))))))))((((((....(((...(((..((((..(((((....))))).....))))..)))...))))))))).....(((.((((((((.....(((..((((((....))))))((((((((....)))))))).......)))....)))).)))).)))..((.(((....(((((((.....))))))).....))).))....))))).))).))).)))).)))))))).....(((((((((((((((((.......(((.((((((.((.....(((((.((((((((.(((.(((((((((..........)))).........))))).))))))((((((.((((..((....))..)))).))))))((((.(.(((((....(((......)))....))))).))))).(((.....))).....)))))..))))).....))..)))))))))........))))))))))).(((((((..........))))))).))))))))))))))))..))..))))))).)))))).))))...)))......(((((.(.(((((..........))))).)))))).(((((((((((((.(((((((.(((........))).....(((((........)))))..((((.(((.......))).)))).......(((....))).............((((((.(((....))).))))))....)))))))..(((((.....))))).(((((((.((((((........)))))).(((((((...)))))))........((.((.(((((......))))).)).))....))))))).....(((((((.......)))))))...)))))))....))))))....(((.((((((((.(((.....(((((((((.(((..(((((.(((((((...((.....))....)).))))).(((((((((.(((.....((((((((.(((.((((((((......(((((..((((..((((.(((((.((((((((((.(((((((....((((....((..((((...........(((........)))......(((((((..((((((..((((((......((((....((((....(((((((.......)))))))......))))....))))...........((((((....((..((.((....)).))..))......))))))...(((.....)))...)))))).)))))))))))))))))..))...))))..((((((((...((((....(((((........((((......))))........(((....))).......))))).(((.......)))..((((((..(((((.....)))))..))))))....)))).....)))))))).))))))).))..))))))))))))).))))...(.((((((((..((....))....)))))))).)((((...)))).))))..)))))...........((((.((((.((((((..........))))))......)))).)))).))))))))((.(((((.....((((((...))))))...)))))))....(((((.((.((((((((((((....)))))).))))))...)).))))).....((((((((..((....))....))))))))....))).))))))))..))).....)))))))))....)))))..)))))))))))).......(((((.....))))).........(((.....((((....))))....)))))))))))))).)))))))))..)).))...))).))))).....(((((...((((((........))))))..)))))))))))))).)))....))...)))))))....(((.(((((((.((.(((((.(((((.......)))))(((((((((...((.(.((((......)))).)))...)).))).))))((((((((....))))))))..................))))).))..))).)))))))....)))))).)))))).......((((((....((((.....))))......))))))(((...)))(((.............)))..........(((((((.((......)).)))).))).....(((..(((((((((..................((((.....))))))))))))).))))))))))))))))).............(((((..(((.((........)).)))..))))).)).)))))))).))))(((((((((.(((((...(((..(..((((((((((......(((((((((.(((((((.((((((.((((.((((((...((((((.(....(((((((((((((((....))))).......))))..(((..(((((.........)))))(((((......)))))..((((......)))).(((.(((.(((((.(((((....)))))))))).))).))))))........))))))...).))))))..)))))).)))).((.(.(((((.....))))).).))(((.(.((((.(((.....((((......((((((.....((((.(((((.(((((((((((((.((((((((((.(((((((....))))))).(((((..((((((..(((((..(((.....(((...))).....))).))))).....))))))....))))).)))))))............)))))))))((((.........))))(((....)))..............))))))).)))))))))...(((.((.((((((....((.....))...)))))).)).)))....))))))......)))))))))))).))).......(((((....))))).)))))).))..(((((.(((((((...(.((.((((....)))).)).)...)))))))))))).)))))...((((......))))...........((((........))))..(((((((........(((((.....(((((((((((((............)))))).........(.((((.((((((...)))))).)))).)...............(((((((((((((..(((((((..(((...((((.(((..((.((......(((((....)))))...))))..)))..)))))))..)))))))..)))))((((.((.((.((((((..(((....)))(((((.......)))))..))))))..)).)).)))).........)))))))).))))).))....)))))((((((((((((((....((((((...((((..((((((((..(.(((((................))))).)..)))))))).........)))).))))))....))))))).))))))).))))))))))))))))...)))))))))).)..)))...)))))))))).)))).))))).)))..(((((((((((((((((((.(((....((((((((((((((..((((.(.((((.((.....((.(((((.((((((((.......((((((.((((....))))))))))(((((.....))))))))).)))).)))))))..)).))))).)))).))))..))))))).))).(((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((...((((..(((((((....((((........))))))))..)))..))))....((((((((..((((((((((....(((((.((((((((((((((...(((..((((((((((((....))).)))))))))......((((((.(((.(((((.(.(((((((...(....)...))))....))).).))))).((((((.((((((......................((.((((((....((((((.(((.......((((((...)))))).(((((.((.(((..(((((((.(((.((((((..((((((((......)))))))).)))))).))).)))))))...)))))))))).((((((..(((......))))))))).....))).)))))))))))).)).....(((((((.((..((((((((((((.......(((....))).........(((((.(((....(((.((((((((..........))))))).).)))....))).)))))...(((((.....)))))..)))).))))))))...))..))))))))))))))))))).....))).)))))).....))).)))))))..............))))))).)))))......(((.(((((..((......((..((((((((....))))))))..))......))..))))))))..))))))))))))))))))....((((((((.((((.(((((((.(((....)))))).))))..))))....))))))))....(((((((((((...((((.......(((((...((((....))))....)))))........))))..))))))..)))))((((.(((((....................(((((....(((((..((((((.....((((((.((((.(((......((((....))))...((((((........................................))))))....)))...)))).))))))...))))))..)))))...))))).....))))).)))).)))))))))).))).(((((......)))))......((((((((.......((((((...))))))....((((............)))).((((((........(((((..(((........((((((....))))))........))))))))....(((((.....((..((((((.((((.....(((((.(((((.((((....))))..))))))))))...........)))).)))))).))...))))).......((((((.......))))))......................))))))....))))))))....))))))))))....((((....))))(((((((.(((..((((((((........)))).))))....))).)))))))(((((.........))))).((((....))))....(((((.(...((..(((((((((((((((...((((((((...((((.(((...(((((((..........((((((...))))))........))))))).))).)))).(((((...)))))..(((((.....)))))....(((((....))))).......((((((...))))))..............))))))))..)))))))(((((((((((..(((....)))........(((((((((....((((((...(..(((((((((((((((((...)))))))).))))).))))..)...)))))).......(.((((.......)))).).)))))))))............((((............)))).....((((((((.((((.((((.........))))...)).)).))))))))...))))))))))).......((((((((((((.....(((...(((.((....)))))....))).....))))))))))))..........)))))))).))....).)))))............))))))).....))))))))).))))))))))))))((((...........)))).......))))))))..)))...(((((.....((((((((.(((((((((...............((((((((((..(((((((((((((((((((((.(((...))).))).).))))...((((((((((...(.((......)).)....)))).))))))...............)))))))))))))...))))......................))))))(((((.(.(((.(((((.((.....(((.((((....)))).)))......)))))))))))))))).))))))))).)))....)))))..))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((.{((((((((((.....)))))))).)){({((({.,((((.(({{,....,,.,)))),)))}...})}}||..(((((((((.(((((.(((((..((((((((((((((((((((...((((((...{((((((((,{.,,,||||||,((((((((...(({..},....)))}))))|||{{{..{,.({{..{{|{.,|||..|||,.||..{{,,,.(((.((((.,((((((((((((..((......((((((((((...(((((((((((((((.,{(,...(((((.....,((({......||||(((((.(((((......))))))))))||{|{{....|||...{((..{(((.,(((,,....}))}}.....}}}}..)}}...}}}}))))}...,.{((.((((({{{..,..{{{.,((((((....))))))|(((((((....))))))),.......,}},.,,})},})))).))}.,|(.(((....(((((((.....))))))).....))).)}....))))).))).))).)))).)))))))),....{((((((((((((((((.,,,,..(((.{{{(({.({,,,,,{{,{{.,,,..,,{.{((.((((((((|..........,,.,.........})))).}}},}}{(((((.((((..((....))..)))).)))))|((((.(.(((((....(((......})),...))))).)))))}(((,...,)))..,,.,,,||...,}}}....|||,.,},))))},.,,,,...))))))))))).(((((((.,,....,}.))))))).)))))}))))))))))..))..))))))).)))))}.))))...)))..,,,,({((({(,((((({,,,...,,,,}|||,||}|}}(((((((((,{,,..{{(((({.,,,.......,||{,.....,|,,..,,,...})}||,.((((.(((.......})).))))..,....,||....}},}}},.........||||||}||,,{{{|||{||,},,.{{{|,|||,,..{(((({...,))))|,(((({|..,|||||,}},...,|||||..(((((((...)))))))...,.},|||((({(..((((((....(((({{,((.{(((.{{{,({{...(((((((.......)))))))...,))).))}.})))))))))))..)))))).}}))}|{{{{..{({((((,,.,{{{,({,...{((((((...((.....}},,..))}}))))..,,,|,,,}}}|,|},.}|||.,},,}}}.....,||}}}}}},.(((((..((((..((((.(((((.((((((((((.(((((((....((({.{,.((..((((...........{((........))}......(((((((..((((((..((((((......((((..,.((((...,(((((((.,....,)))))))......))))....)))}...........((((((.,..,,..{{.,,....}).,}..)}......))))))...(((.....)))...)))))).)))))))))))))))))..)).}}))))..((((((((.,.((((,,.{((..,..||,.,.{{{{......))))||......|((.||.}||.|,,...,})},.|||.,|,,.,)}},.((((((..(((((.....)))))..))))))....)))}.....)))))))).))))))).))..))))))))))))).))))...(.((((((((..((....))....)))))))).)((((...)))).)))}..)))))...((((({{{(((((.....((((((..,.......)))))).....,|.,,{,{|{(((({((({((,(((((,{,,.((((((...))))))...}))))},.,))))||.}},,((((((((((((....)))))).))))))...}}.,,,,,||,..{|||{{{|}}||,..,)),,.,)))))}}}.......)))))))))},)).......}}))))}})),.))),})))},))}},,))).......(((((.....)))))......,,|{{{.....{(((....)))}..((((((.,,.((((({(((((....))))).)}.......,,}))}}...|||||}..{(((((........)))))).,})))}}))))}|||{||}....,,.}}))))}}}....(({.{{{{,(({((.((({{.(((((.......)))))(((((((((...{(,(.((({....,,)))).}})...)).))).))))((((((((....))))))))..},,.,,.,........))))),)))})},.)}))}))....)))))).)))))).......((((((....((((.....)))),.....)))))}(((...}},(((.,{,.........))).,,.......,((((((.({.....})).)))).}}},....(((..(((((((((........,,,....,,,((((.....))))))))))))).)))))))))))))))))..,,,.....,..(((((..(((.((........)).)))..))))).))}}))))))).))))(((((((((.(((((...{{{.,({.((((((((((......(((((((((.{{(({((,({(((,.((((.((((((...((((((.{,,..{({((((((,,,,,,.||}}}),},||,..,||||{{{{{..,{{{{.....,...})))}|{|||...,,,)}})}..((((......)))).(((.(((.(((((((((((....)))))))))).))).))))}},.,,,,},)))))).,,|,))))))..)))))).)))}{{{{{.{(((({{.{,}},}},|||||||,}.|||}}{((((.(((((((((((({{({.{,..({{((((.{((((...((((((.((..,.,(((((((.(((((((....))))))).(((((.,((((((..(((((..(((.....(((...))).....))).)))))..,,,),}}))....))))).))))))).........)).))).)))..,..........{((((.((((((..(((((((.{.(....).}.)))))))(((((....)))))...((((((.,,,({....,))...))))))...,,))},})),))))|)))))}})}))})}..,),))))).....))))))))...)))))}}}},)}||{{{{{{{{{{{{{...{.((.((((....)))).}},},,,}}}||}}.,||}.,}}}},,.((((......))))....,,...|}||{|........|||||,((({(({..,,....,,.||.,||.|||((((((,{,({(((({...{(((({||..........(.((((.((((({...}))))).)))).)....{{.,,,,....}}}.||..(((,,...,,,,.|},}},.}}|}}}.})}}}}}.)}))))..(((((....))))).,,),.,}))))},}}}||||{.|||||{{.{{||,|((({.((((,.(((((({,{((....)}},,,,,...}}}}))))}.,)))))),.},))).)))).}}}}}}).)))))..,,})))){||{|..|,,.{((((((((((((((....((((((...((((..((((((((..(.(((((.............,..))))).)..)))))))).........)))).))))))....))))))).)))))))).}))))))))))))))...)))))))))).).,))).,.)))))))))).)))).))))).||,,.(((((((((((((((((((.{{{....{((((((((({(((..((((.,.((((,((.,,..((,(((((.(((({{{{,,(((,.{(((((.((((....)))))))))},||||}}}},}},,}}))},)))).)))))}),.)),)))}}.)))).)))}..))))))).}}}.((({(({{({((((((({((((((((({{(((((((((({,,,((({..((((({{...||(({,{{...|})))))}}}..})).{||||....,.,,,.(({{{{{((((,,,...||||||}||((((((((((,(,.((((..((((((((((((....)))))})))))))....,.{((((..{{..(((((.(.(((,,(({,.(....,...,,))}}}.))).}.))))).}.}}...))))},.,,......({(((,...,)))))...,,}}}}.}}.})),}}))})},{{{(((((({,.,{{((((((((.((({.(({{(((((((.(((.{((((((,((((((((,....,))))))))))))))}.))).)))))))..{{{{.{{.....((((((..(((......)))))))))....})))})|{{{{(({|||({{{,,,,{((((((.{{..((((((((((((,......|||,,,.||,.........(((((.(({....{((.{(((((((..........))))))).).)))....})).))))}...,{||{.....}))}}..}))).))))))))...))..))))))},,.}||.,,{||{.{{{{{{{{.{{{....{{{{{{{{{...,,,,.((({{......,}}|}}.,|,.{{{{{{{{{{,,||||},||}...,.((..((((((((....))))))))..))|||,.,||,{||}}|||||||((((||||{{{||||,,,||||||||{{{.|{{|,||{{|||,(((,...}}}))),}}}},.))}).,..}))))))}...,{{{{(({(((({{.(((({{.....(({{,...,||,....))),}}}.)))))}.,,....}}))},)))}}},,)})))}}}}}|||||,,,,,,...,}},,,,....,,}||}}|}||,,,.}||,,||}}}}}|,||||.,|||,,||}}}}},{|||...,|}}}...((((((..,,................................,,..))))))....,,}})})),.}))),))}.}))))}),.,))},.,,)))))}}{{,....,.)))..}))))))))}.}}|{(((((......))))).}},|,((({((({...,,,.{{{{{(...}}}}}}....{{|||||,..,.,...}}}},||||{{{{,...{.{((((,.,((........(((((,....})))))........)))))))),...{((({.....((..((((((.((((.,,..(((((.(((((.((((....))))..))))))))))...,.......)))).)))))).}}...})))).,.....{{{{{{.......}}}}}},},...........{{{{....,,),)))}..})))))})....))))))))))....{{{{....))}}(((((((.(((..((((((((........)))).))))....))).))))))){{(((.........)))}}.,{({{{{{|}||{...(((((.(...((..(((((((((((((((.,,((({{{((...,,{{.{,,...{{{{(({........,,((((({...,||||}.....,,.,}}|}}}.,,,,|,,..(((((...)))))..,{{((((..((((......(((({....})))).......}|||,|}}}}|||||,........,,.,,))))))))..)))))))||{{|{{|||||.|||,..,||,.|||,,,|((({||{{{.,,,(((({{,,,{,.{((((((({((((((((...)))))))).})))).)))),.|..,}}}}}),..,,,,|,||||....{|,}}}|{,.}}}}}}}}},,..........,(((.....},.,,,,,,}}.....{{((((((.((((.((((.{{....,,))))...)).)).))))))||,,,|,,,,,))))),......(((,{((((((,,....|,|}}}|}|.}},.,,||}||{{{{,,,..}}})))))))}))))..........)))))))).))....).))))).,,,.,}}},.,})))),)}},..))})))))).))})))))))))))((((...........)))).......)))))))).,)))...,((((,....((((((((.(((((((((..,,,,,{{{{....,,((((((((..(((((((((((((,,{,,(((.(({...})).))|,|,,|||...{(((((((((...{{((.....,)).,....)))),})))))}}.},,.........)))))))))))))...)))},))}}....,,},}},,,..........{((((.(.(((.(((({,((.,,,.(((.((((....)))).)))..,.,.)))))))))))))))}.))))))))).)))....))))),.})))).

Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001371136.1 AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6464 nt 0.4197
NM_001371137.1 AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6169 nt 0.4198
NM_001371138.1 AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6539 nt 0.4206
NM_001371139.1 AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6519 nt 0.4232
NM_001371140.1 AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6455 nt 0.4206
NM_001371141.1 AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6389 nt 0.4207
NM_001371142.1 AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6330 nt 0.4201
NM_001371143.1 AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6432 nt 0.4220
NM_001371144.1 AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6686 nt 0.4195
NM_001371145.1 AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6491 nt 0.4210
Showing 21 to 30 of 68 entries
Summary

Cell adhesion molecules (CAMs) are members of the immunoglobulin superfamily. This gene encodes a neuronal cell adhesion molecule with multiple immunoglobulin-like C2-type domains and fibronectin type-III domains. This ankyrin-binding protein is involved in neuron-neuron adhesion and promotes directional signaling during axonal cone growth. This gene is also expressed in non-neural tissues and may play a general role in cell-cell communication via signaling from its intracellular domain to the actin cytoskeleton during directional cell migration. Allelic variants of this gene have been associated with autism and addiction vulnerability. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image