Basic Information
Symbol
NRCAM
RNA Class
mRNA
Alias
neuronal cell adhesion molecule
KIAA0343
Bravo
NgCAM-related cell adhesion molecule
NEDNMS
neuronal surface protein Bravo
Neuronal cell adhesion molecule
Nr-CAM
Neuronal surface protein Bravo
hBravo
Ng-CAM-related
Location (GRCh38)
7:108147623-108456717
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001037132.4
Sequence length
6701 nt
GC Content
0.4214
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1859.39 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1991.12 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1820.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.(((((((((((.....)))))))).)))(.((((.(((((.((.......)).))))))))).).....(((..(((((((((.(((((.(((((..((((((((((((((((((((...((((((...(((((((((...((((((((((((((((((.(.(((........))).)))))))(((.....))).((((((((..((.((..((((((....(((.((((.(((((((((((((..((......((((((((((...(((((((((((((((.(((....(((((......((((......))))(((((.(((((......))))))))))((((((....(((...(((..((((..(((((....))))).....))))..)))...))))))))).....(((.((((((((.....(((..((((((....))))))((((((((....)))))))).......)))....)))).)))).)))..((.(((....(((((((.....))))))).....))).))....))))).))).))).)))).)))))))).....(((((((((((((((((.......(((.((((((.((.....(((((.((((((((.(((.(((((((((..........)))).........))))).))))))((((((.((((..((....))..)))).))))))((((.(.(((((....(((......)))....))))).))))).(((.....))).....)))))..))))).....))..)))))))))........))))))))))).(((((((..........))))))).))))))))))))))))..))..))))))).)))))).))))...)))......(((((.(.(((((..........))))).)))))).(((((((((((((.(((((((.(((........))).....(((((........)))))..((((.(((.......))).)))).......(((....))).............((((((.(((....))).))))))....)))))))..(((((.....))))).(((((((.((((((........)))))).(((((((...)))))))........((.((.(((((......))))).)).))....))))))).....(((((((.......)))))))...)))))))....))))))....(((.((((((((.(((.....(((((((((.(((..(((((.(((((((...((.....))....)).))))).(((((((((.(((.....((((((((.(((.((((((((......(((((..((((..((((.(((((.((((((((((.(((((((....((((....((..((((...........(((........)))......(((((((..((((((..((((((......((((....((((....(((((((.......)))))))......))))....))))...........((((((....((..((.((....)).))..))......))))))...(((.....)))...)))))).)))))))))))))))))..))...))))..((((((((...((((....(((((........((((......))))........(((....))).......))))).(((.......)))..((((((..(((((.....)))))..))))))....)))).....)))))))).))))))).))..))))))))))))).))))...(.((((((((..((....))....)))))))).)((((...)))).))))..)))))...........((((.((((.((((((..........))))))......)))).)))).))))))))((.(((((.....((((((...))))))...)))))))....(((((.((.((((((((((((....)))))).))))))...)).))))).....((((((((..((....))....))))))))....))).))))))))..))).....)))))))))....)))))..)))))))))))).......(((((.....))))).........(((.....((((....))))....)))))))))))))).)))))))))..)).))...))).))))).....(((((...((((((........))))))..)))))))))))))).)))....))...)))))))....(((.(((((((.((.(((((.(((((.......)))))(((((((((...((.(.((((......)))).)))...)).))).))))((((((((....))))))))..................))))).))..))).)))))))....)))))).)))))).......((((((....((((.....))))......))))))(((...)))(((.............)))..........(((((((.((......)).)))).))).....(((..(((((((((..................((((.....))))))))))))).))))))))))))))))).............(((((..(((.((........)).)))..))))).)).)))))))).))))(((((((((.(((((...(((..(..((((((((((......(((((((((.(((((((.((((((.((((.((((((...((((((.(....(((((((((((((((....))))).......))))..(((..(((((.........)))))(((((......)))))..((((......)))).(((.(((.(((((.(((((....)))))))))).))).))))))........))))))...).))))))..)))))).)))).((.(.(((((.....))))).).))(((.(.((((.(((.....((((......((((((.....((((.(((((.(((((((((((((.((((((((((.(((((((....))))))).(((((..((((((..(((((..(((.....(((...))).....))).))))).....))))))....))))).)))))))............)))))))))((((.........))))(((....)))..............))))))).)))))))))...(((.((.((((((....((.....))...)))))).)).)))....))))))......)))))))))))).))).......(((((....))))).)))))).))..(((((.(((((((...(.((.((((....)))).)).)...)))))))))))).)))))...((((......))))...........((((........))))..(((((((........(((((.....(((((((((((((............)))))).........(.((((.((((((...)))))).)))).)...............(((((((((((((..(((((((..(((...((((.(((..((.((......(((((....)))))...))))..)))..)))))))..)))))))..)))))((((.((.((.((((((..(((....)))(((((.......)))))..))))))..)).)).)))).........)))))))).))))).))....)))))((((((((((((((....((((((...((((..((((((((..(.(((((................))))).)..)))))))).........)))).))))))....))))))).))))))).))))))))))))))))...)))))))))).)..)))...)))))))))).)))).))))).)))..(((((((((((((((((((.(((....((((((((((((((..((((.(.((((.((.....((.(((((.((((((((.......((((((.((((....))))))))))(((((.....))))))))).)))).)))))))..)).))))).)))).))))..))))))).))).(((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((...((((..(((((((....((((........))))))))..)))..))))....((((((((..((((((((((....(((((.((((((((((((((...(((..((((((((((((....))).)))))))))......((((((.(((.(((((.(.(((((((...(....)...))))....))).).))))).((((((.((((((......................((.((((((....((((((.(((.......((((((...)))))).(((((.((.(((..(((((((.(((.((((((..((((((((......)))))))).)))))).))).)))))))...)))))))))).((((((..(((......))))))))).....))).)))))))))))).)).....(((((((.((..((((((((((((.......(((....))).........(((((.(((....(((.((((((((..........))))))).).)))....))).)))))...(((((.....)))))..)))).))))))))...))..))))))))))))))))))).....))).)))))).....))).)))))))..............))))))).)))))......(((.(((((..((......((..((((((((....))))))))..))......))..))))))))..))))))))))))))))))....((((((((.((((.(((((((.(((....)))))).))))..))))....))))))))....(((((((((((...((((.......(((((...((((....))))....)))))........))))..))))))..)))))((((.(((((....................(((((....(((((..((((((.....((((((.((((.(((......((((....))))...((((((........................................))))))....)))...)))).))))))...))))))..)))))...))))).....))))).)))).)))))))))).))).(((((......)))))......((((((((.......((((((...))))))....((((............)))).((((((........(((((..(((........((((((....))))))........))))))))....(((((.....((..((((((.((((.....(((((.(((((.((((....))))..))))))))))...........)))).)))))).))...))))).......((((((.......))))))......................))))))....))))))))....))))))))))....((((....))))(((((((.(((..((((((((........)))).))))....))).)))))))(((((.........))))).((((....))))....(((((.(...((..(((((((((((((((...((((((((...((((.(((...(((((((..........((((((...))))))........))))))).))).)))).(((((...)))))..(((((.....)))))....(((((....))))).......((((((...))))))..............))))))))..)))))))(((((((((((..(((....)))........(((((((((....((((((...(..(((((((((((((((((...)))))))).))))).))))..)...)))))).......(.((((.......)))).).)))))))))............((((............)))).....((((((((.((((.((((.........))))...)).)).))))))))...))))))))))).......((((((((((((.....(((...(((.((....)))))....))).....))))))))))))..........)))))))).))....).)))))............))))))).....))))))))).))))))))))))))((((...........)))).......))))))))..)))...(((((.....((((((((.(((((((((...............((((((((((..(((((((((((((((((((((.(((...))).))).).))))...((((((((((...(.((......)).)....)))).))))))...............)))))))))))))...))))......................))))))(((((.(.(((.(((((.((.....(((.((((....)))).)))......)))))))))))))))).))))))))).)))....)))))..))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((.{((((((((((.....)))))))).)){({((({.,((((.(({{,....,,.,)))),)))}...})}}||..(((((((((.(((((.(((((..((((((((((((((((((((...((((((...{((((((((,{.,,,||||||,((((((((...(({..},....)))}))))|||{{{..{,.({{..{{|{.,|||..|||,.||..{{,,,.(((.((((.,((((((((((((..((......((((((((((...(((((((((((((((.,{(,...(((((.....,((({......||||(((((.(((((......))))))))))||{|{{....|||...{((..{(((.,(((,,....}))}}.....}}}}..)}}...}}}}))))}...,.{((.((((({{{..,..{{{.,((((((....))))))|(((((((....))))))),.......,}},.,,})},})))).))}.,|(.(((....(((((((.....))))))).....))).)}....))))).))).))).)))).)))))))),....{((((((((((((((((.,,,,..(((.{{{(({.({,,,,,{{,{{.,,,..,,{.{((.((((((((|..........,,.,.........})))).}}},}}{(((((.((((..((....))..)))).)))))|((((.(.(((((....(((......})),...))))).)))))}(((,...,)))..,,.,,,||...,}}}....|||,.,},))))},.,,,,...))))))))))).(((((((.,,....,}.))))))).)))))}))))))))))..))..))))))).)))))}.))))...)))..,,,,({((({(,((((({,,,...,,,,}|||,||}|}}(((((((((,{,,..{{(((({.,,,.......,||{,.....,|,,..,,,...})}||,.((((.(((.......})).))))..,....,||....}},}}},.........||||||}||,,{{{|||{||,},,.{{{|,|||,,..{(((({...,))))|,(((({|..,|||||,}},...,|||||..(((((((...)))))))...,.},|||((({(..((((((....(((({{,((.{(((.{{{,({{...(((((((.......)))))))...,))).))}.})))))))))))..)))))).}}))}|{{{{..{({((((,,.,{{{,({,...{((((((...((.....}},,..))}}))))..,,,|,,,}}}|,|},.}|||.,},,}}}.....,||}}}}}},.(((((..((((..((((.(((((.((((((((((.(((((((....((({.{,.((..((((...........{((........))}......(((((((..((((((..((((((......((((..,.((((...,(((((((.,....,)))))))......))))....)))}...........((((((.,..,,..{{.,,....}).,}..)}......))))))...(((.....)))...)))))).)))))))))))))))))..)).}}))))..((((((((.,.((((,,.{((..,..||,.,.{{{{......))))||......|((.||.}||.|,,...,})},.|||.,|,,.,)}},.((((((..(((((.....)))))..))))))....)))}.....)))))))).))))))).))..))))))))))))).))))...(.((((((((..((....))....)))))))).)((((...)))).)))}..)))))...((((({{{(((((.....((((((..,.......)))))).....,|.,,{,{|{(((({((({((,(((((,{,,.((((((...))))))...}))))},.,))))||.}},,((((((((((((....)))))).))))))...}}.,,,,,||,..{|||{{{|}}||,..,)),,.,)))))}}}.......)))))))))},)).......}}))))}})),.))),})))},))}},,))).......(((((.....)))))......,,|{{{.....{(((....)))}..((((((.,,.((((({(((((....))))).)}.......,,}))}}...|||||}..{(((((........)))))).,})))}}))))}|||{||}....,,.}}))))}}}....(({.{{{{,(({((.((({{.(((((.......)))))(((((((((...{(,(.((({....,,)))).}})...)).))).))))((((((((....))))))))..},,.,,.,........))))),)))})},.)}))}))....)))))).)))))).......((((((....((((.....)))),.....)))))}(((...}},(((.,{,.........))).,,.......,((((((.({.....})).)))).}}},....(((..(((((((((........,,,....,,,((((.....))))))))))))).)))))))))))))))))..,,,.....,..(((((..(((.((........)).)))..))))).))}}))))))).))))(((((((((.(((((...{{{.,({.((((((((((......(((((((((.{{(({((,({(((,.((((.((((((...((((((.{,,..{({((((((,,,,,,.||}}}),},||,..,||||{{{{{..,{{{{.....,...})))}|{|||...,,,)}})}..((((......)))).(((.(((.(((((((((((....)))))))))).))).))))}},.,,,,},)))))).,,|,))))))..)))))).)))}{{{{{.{(((({{.{,}},}},|||||||,}.|||}}{((((.(((((((((((({{({.{,..({{((((.{((((...((((((.((..,.,(((((((.(((((((....))))))).(((((.,((((((..(((((..(((.....(((...))).....))).)))))..,,,),}}))....))))).))))))).........)).))).)))..,..........{((((.((((((..(((((((.{.(....).}.)))))))(((((....)))))...((((((.,,,({....,))...))))))...,,))},})),))))|)))))}})}))})}..,),))))).....))))))))...)))))}}}},)}||{{{{{{{{{{{{{...{.((.((((....)))).}},},,,}}}||}}.,||}.,}}}},,.((((......))))....,,...|}||{|........|||||,((({(({..,,....,,.||.,||.|||((((((,{,({(((({...{(((({||..........(.((((.((((({...}))))).)))).)....{{.,,,,....}}}.||..(((,,...,,,,.|},}},.}}|}}}.})}}}}}.)}))))..(((((....))))).,,),.,}))))},}}}||||{.|||||{{.{{||,|((({.((((,.(((((({,{((....)}},,,,,...}}}}))))}.,)))))),.},))).)))).}}}}}}).)))))..,,})))){||{|..|,,.{((((((((((((((....((((((...((((..((((((((..(.(((((.............,..))))).)..)))))))).........)))).))))))....))))))).)))))))).}))))))))))))))...)))))))))).).,))).,.)))))))))).)))).))))).||,,.(((((((((((((((((((.{{{....{((((((((({(((..((((.,.((((,((.,,..((,(((((.(((({{{{,,(((,.{(((((.((((....)))))))))},||||}}}},}},,}}))},)))).)))))}),.)),)))}}.)))).)))}..))))))).}}}.((({(({{({((((((({((((((((({{(((((((((({,,,((({..((((({{...||(({,{{...|})))))}}}..})).{||||....,.,,,.(({{{{{((((,,,...||||||}||((((((((((,(,.((((..((((((((((((....)))))})))))))....,.{((((..{{..(((((.(.(((,,(({,.(....,...,,))}}}.))).}.))))).}.}}...))))},.,,......({(((,...,)))))...,,}}}}.}}.})),}}))})},{{{(((((({,.,{{((((((((.((({.(({{(((((((.(((.{((((((,((((((((,....,))))))))))))))}.))).)))))))..{{{{.{{.....((((((..(((......)))))))))....})))})|{{{{(({|||({{{,,,,{((((((.{{..((((((((((((,......|||,,,.||,.........(((((.(({....{((.{(((((((..........))))))).).)))....})).))))}...,{||{.....}))}}..}))).))))))))...))..))))))},,.}||.,,{||{.{{{{{{{{.{{{....{{{{{{{{{...,,,,.((({{......,}}|}}.,|,.{{{{{{{{{{,,||||},||}...,.((..((((((((....))))))))..))|||,.,||,{||}}|||||||((((||||{{{||||,,,||||||||{{{.|{{|,||{{|||,(((,...}}}))),}}}},.))}).,..}))))))}...,{{{{(({(((({{.(((({{.....(({{,...,||,....))),}}}.)))))}.,,....}}))},)))}}},,)})))}}}}}|||||,,,,,,...,}},,,,....,,}||}}|}||,,,.}||,,||}}}}}|,||||.,|||,,||}}}}},{|||...,|}}}...((((((..,,................................,,..))))))....,,}})})),.}))),))}.}))))}),.,))},.,,)))))}}{{,....,.)))..}))))))))}.}}|{(((((......))))).}},|,((({((({...,,,.{{{{{(...}}}}}}....{{|||||,..,.,...}}}},||||{{{{,...{.{((((,.,((........(((((,....})))))........)))))))),...{((({.....((..((((((.((((.,,..(((((.(((((.((((....))))..))))))))))...,.......)))).)))))).}}...})))).,.....{{{{{{.......}}}}}},},...........{{{{....,,),)))}..})))))})....))))))))))....{{{{....))}}(((((((.(((..((((((((........)))).))))....))).))))))){{(((.........)))}}.,{({{{{{|}||{...(((((.(...((..(((((((((((((((.,,((({{{((...,,{{.{,,...{{{{(({........,,((((({...,||||}.....,,.,}}|}}}.,,,,|,,..(((((...)))))..,{{((((..((((......(((({....})))).......}|||,|}}}}|||||,........,,.,,))))))))..)))))))||{{|{{|||||.|||,..,||,.|||,,,|((({||{{{.,,,(((({{,,,{,.{((((((({((((((((...)))))))).})))).)))),.|..,}}}}}),..,,,,|,||||....{|,}}}|{,.}}}}}}}}},,..........,(((.....},.,,,,,,}}.....{{((((((.((((.((((.{{....,,))))...)).)).))))))||,,,|,,,,,))))),......(((,{((((((,,....|,|}}}|}|.}},.,,||}||{{{{,,,..}}})))))))}))))..........)))))))).))....).))))).,,,.,}}},.,})))),)}},..))})))))).))})))))))))))((((...........)))).......)))))))).,)))...,((((,....((((((((.(((((((((..,,,,,{{{{....,,((((((((..(((((((((((((,,{,,(((.(({...})).))|,|,,|||...{(((((((((...{{((.....,)).,....)))),})))))}}.},,.........)))))))))))))...)))},))}}....,,},}},,,..........{((((.(.(((.(((({,((.,,,.(((.((((....)))).)))..,.,.)))))))))))))))}.))))))))).)))....))))),.})))).
Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001371166.1 | AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… | 6270 nt | 0.4246 |
| NM_001371167.1 | AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… | 6483 nt | 0.4236 |
| NM_001371168.1 | AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… | 6576 nt | 0.4227 |
| NM_001371169.1 | AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… | 6665 nt | 0.4210 |
| NM_001371170.1 | AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… | 6138 nt | 0.4192 |
| NM_001371171.1 | AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… | 6436 nt | 0.4209 |
| NM_001371172.1 | AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… | 6644 nt | 0.4219 |
| NM_001371173.1 | AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… | 6398 nt | 0.4200 |
| NM_001371174.1 | AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… | 6356 nt | 0.4190 |
| NM_001371175.1 | AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… | 6038 nt | 0.4192 |
Showing 51 to 60 of 68 entries
Summary
Cell adhesion molecules (CAMs) are members of the immunoglobulin superfamily. This gene encodes a neuronal cell adhesion molecule with multiple immunoglobulin-like C2-type domains and fibronectin type-III domains. This ankyrin-binding protein is involved in neuron-neuron adhesion and promotes directional signaling during axonal cone growth. This gene is also expressed in non-neural tissues and may play a general role in cell-cell communication via signaling from its intracellular domain to the actin cytoskeleton during directional cell migration. Allelic variants of this gene have been associated with autism and addiction vulnerability. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
