Basic Information

Symbol
NRIP1
RNA Class
mRNA
Alias
nuclear receptor interacting protein 1 RIP140 receptor interacting protein 140 nuclear factor RIP140 CAKUT3 nuclear receptor-interacting protein 1 receptor-interacting protein 140 Nuclear receptor-interacting protein 1 Nuclear factor RIP140 Receptor-interacting protein 140
Location (GRCh38)
21:14961235-15065936 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_003489.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_003489.4
Sequence length
7751 nt
GC Content
0.3879

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2044.44 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2197.57 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1890.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_003489.4 AGACAUUGCAGCAGAGCCCCGAACUCGGGAGGCGGCGGCGGAGGAGGCG… 7751 nt 0.3879
Summary

Nuclear receptor interacting protein 1 (NRIP1) is a nuclear protein that specifically interacts with the hormone-dependent activation domain AF2 of nuclear receptors. Also known as RIP140, this protein modulates transcriptional activity of the estrogen receptor. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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