Basic Information
Symbol
NSUN2
RNA Class
mRNA
Alias
NOP2/Sun RNA methyltransferase 2
FLJ20303
TRM4
Misu
SAKI
tRNA methyltransferase 4 homolog (S. cerevisiae)
Myc-induced SUN-domain-containing protein
RNA cytosine C(5)-methyltransferase NSUN2
NOL1/NOP2/Sun domain family, member 2
NOP2/Sun domain family, member 2
mental retardation, non-syndromic, autosomal recessive, 5
MRT5
5-methycytoisine methyltransferase
NOP2/Sun RNA methyltransferase family member 2
mRNA cytosine C(5)-methyltransferase
myc-induced SUN domain-containing protein
substrate of AIM1/Aurora kinase B
tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase
tRNA (cytosine-5-)-methyltransferase NSUN2
tRNA cytosine C(5)-methyltransferase
tRNA methyltransferase 4 homolog
Myc-induced SUN domain-containing protein
NOL1/NOP2/Sun domain family member 2
Substrate of AIM1/Aurora kinase B
hTrm4
EC 2.1.1.-
EC 2.1.1.203
EC 2.1.1.29
EC 2.1.1
Location (GRCh38)
5:6599237-6633304
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_017755.6
Sequence length
3056 nt
GC Content
0.4692
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-959.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1019.65 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1025.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001193455.2 | GUAGGGCUAGAGUUCUGGCCGUGGCGGGCCGGUUUCUGCGUGCUGCGUG… | 2951 nt | 0.4703 |
| NM_017755.6 | GUAGGGCUAGAGUUCUGGCCGUGGCGGGCCGGUUUCUGCGUGCUGCGUG… | 3056 nt | 0.4692 |
Summary
This gene encodes a methyltransferase that catalyzes the methylation of cytosine to 5-methylcytosine (m5C) at position 34 of intron-containing tRNA(Leu)(CAA) precursors. This modification is necessary to stabilize the anticodon-codon pairing and correctly translate the mRNA. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been noted for this gene.[provided by RefSeq, Mar 2011]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
