Basic Information

Symbol
NSUN2
RNA Class
mRNA
Alias
NOP2/Sun RNA methyltransferase 2 FLJ20303 TRM4 Misu SAKI tRNA methyltransferase 4 homolog (S. cerevisiae) Myc-induced SUN-domain-containing protein RNA cytosine C(5)-methyltransferase NSUN2 NOL1/NOP2/Sun domain family, member 2 NOP2/Sun domain family, member 2 mental retardation, non-syndromic, autosomal recessive, 5 MRT5 5-methycytoisine methyltransferase NOP2/Sun RNA methyltransferase family member 2 mRNA cytosine C(5)-methyltransferase myc-induced SUN domain-containing protein substrate of AIM1/Aurora kinase B tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase tRNA (cytosine-5-)-methyltransferase NSUN2 tRNA cytosine C(5)-methyltransferase tRNA methyltransferase 4 homolog Myc-induced SUN domain-containing protein NOL1/NOP2/Sun domain family member 2 Substrate of AIM1/Aurora kinase B hTrm4 EC 2.1.1.- EC 2.1.1.203 EC 2.1.1.29 EC 2.1.1

Secondary Structure

MANE Select
NM_017755.6
Sequence length
3056 nt
GC Content
0.4692

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-959.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1019.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1025.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001193455.2 GUAGGGCUAGAGUUCUGGCCGUGGCGGGCCGGUUUCUGCGUGCUGCGUG… 2951 nt 0.4703
NM_017755.6 GUAGGGCUAGAGUUCUGGCCGUGGCGGGCCGGUUUCUGCGUGCUGCGUG… 3056 nt 0.4692
Summary

This gene encodes a methyltransferase that catalyzes the methylation of cytosine to 5-methylcytosine (m5C) at position 34 of intron-containing tRNA(Leu)(CAA) precursors. This modification is necessary to stabilize the anticodon-codon pairing and correctly translate the mRNA. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been noted for this gene.[provided by RefSeq, Mar 2011]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image