Basic Information
Symbol
ODAD2
RNA Class
mRNA
Alias
outer dynein arm docking complex subunit 2
FLJ10817
FLJ10376
DKFZP434P1735
CILD23
gudu
armadillo repeat containing 4
ARMC4
outer dynein arm-docking complex subunit 2
armadillo repeat-containing protein 4
testis tissue sperm-binding protein Li 74n
Outer dynein arm-docking complex subunit 2
Armadillo repeat-containing protein 4
Location (GRCh38)
10:27775186-27999532
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_018076.5
Sequence length
3603 nt
GC Content
0.4308
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1011.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1084.6 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
747.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001290020.2 | ACAAGGGCGCCGGCGUGCGCGGCCGCAGGGCGCGCAGUGUUGACCCGCG… | 3612 nt | 0.4330 |
| NM_001290021.2 | ACUUCUCUGCUGAACAGCAGAGUGCCUUACAUGCAUAUAGGAGGGCAAA… | 2523 nt | 0.4380 |
| NM_001312689.2 | AGUCUUCCUUUAGCUGAUUCUAAUGACGGAGCCUAAUAACCUAGCCUGG… | 2742 nt | 0.4311 |
| NM_018076.5 | AGCGCGGGCGCAGAGCGUCUCUGGCGCGGGCAUACGGUGCAACGGGUCC… | 3603 nt | 0.4308 |
Summary
The protein encoded by this gene contains ten Armadillo repeat motifs (ARMs) and one HEAT repeat, and is thought to be involved in ciliary and flagellar movement. This protein has been shown to localize to the ciliary axonemes and at the ciliary base of respiratory cells. Studies indicate that mutations in this gene cause partial outer dynein arm (ODA) defects in respiratory cilia. The cilia of cells with mutations in this gene displayed either reduced ciliary beat frequency and amplitude, or, complete immotility. Some individuals with primary ciliary dyskensia (PCD) have been shown to have mutations in this gene. PCD is characterized by chronic airway disease and left/right body asymmetry defects. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Aug 2015]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
