Basic Information
Symbol
ODF1
RNA Class
mRNA
Alias
outer dense fiber of sperm tails 1
ODFPG
ODF27
RT7
HSPB10
CT133
cancer/testis antigen 133
outer dense fibre of sperm tails 1
ODF
ODF2
ODFP
ODFPGA
ODFPGB
SODF
outer dense fiber protein 1
heat shock protein beta-10
heat shock protein family B member 10
outer dense fiber of sperm tails, 27-kD
Outer dense fiber protein 1
Heat shock protein beta-10
HspB10
Heat shock protein family B member 10
Location (GRCh38)
8:102551589-102561018
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_024410.4
Sequence length
1026 nt
GC Content
0.4795
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-291.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-315.5 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
257.7
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_024410.4 | AGAACACAAGCUUUAAAGUAAGUGAAUCAUGUGUGCCUCAUUUAUUUUU… | 1026 nt | 0.4795 |
Summary
The outer dense fibers are cytoskeletal structures that surround the axoneme in the middle piece and principal piece of the sperm tail. The fibers function in maintaining the elastic structure and recoil of the sperm tail as well as in protecting the tail from shear forces during epididymal transport and ejaculation. Defects in the outer dense fibers lead to abnormal sperm morphology and infertility. The human outer dense fibers contains at least 10 major proteins and this gene encodes the main protein. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
