Basic Information

Symbol
ARHGAP26
RNA Class
mRNA
Alias
Rho GTPase activating protein 26 GRAF KIAA0621 OPHN1L OPHN1L1 GTPase regulator associated with the focal adhesion kinase pp125 GRAF1 rho GTPase-activating protein 26 GTPase regulator associated with focal adhesion kinase pp125(FAK) oligophrenin-1-like protein Rho GTPase-activating protein 26 GTPase regulator associated with focal adhesion kinase Oligophrenin-1-like protein Rho-type GTPase-activating protein 26
Location (GRCh38)
5:142770377-143229011 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001135608.3
BLAST PRIMER
NM_001349547.2
BLAST PRIMER
NM_015071.6
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_001135608.3
Sequence length
9226 nt
GC Content
0.4704

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3098.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -3266.44 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2223.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
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NM_001349547.2 AGAGUGCCGAGCGCGCCGCAGCCAGCGGGCAGAUCCCAUCGUGUCCACA… 8729 nt 0.4557
NM_015071.6 AGACACCGGCGGGGCGGCCGAGGCUGCUGUGAGAGGGCGCUCGAGGCUG… 9395 nt 0.4708
Summary

Interaction of a cell with the extracellular matrix triggers integrin cell surface receptors to begin signaling cascades that regulate the organization of the actin-cytoskeleton. One of the proteins involved in these cascades is focal adhesion kinase. The protein encoded by this gene is a GTPase activating protein that binds to focal adhesion kinase and mediates the activity of the GTP binding proteins RhoA and Cdc42. Defects in this gene are a cause of juvenile myelomonocytic leukemia (JMML). Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2017]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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