Basic Information
Symbol
ONECUT2
RNA Class
mRNA
Alias
one cut homeobox 2
OC-2
one cut domain, family member 2
OC2
one cut domain family member 2
HNF-6-beta
ONECUT-2 homeodomain transcription factor
hepatocyte nuclear factor 6-beta
onecut 2
transcription factor ONECUT-2
HNF6B
One cut domain family member 2
Hepatocyte nuclear factor 6-beta
One cut homeobox 2
Transcription factor ONECUT-2
Location (GRCh38)
18:57435374-57491298
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_004852.3
Sequence length
16433 nt
GC Content
0.4221
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4658.47 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-4960.87 kcal/mol
Frequency:
8.11e-214
Diversity:
3784.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_004852.3 | AGAGCCCUUCUGGACAGCUCCCGCUCACCCAAACAGAAGACGUCGGCGC… | 16433 nt | 0.4221 |
Summary
This gene encodes a member of the onecut family of transcription factors, which are characterized by a cut domain and an atypical homeodomain. The protein binds to specific DNA sequences and stimulates expression of target genes, including genes involved in melanocyte and hepatocyte differentiation. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
